非法转让土地行为的收益一般不可以直接抵工程款。以下从几个角度进行详细分析：
一、法律性质与规定
非法转让土地行为的违法性：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，土地的使用权转让必须遵循法定程序和条件。非法转让土地，即未经批准或违反批准条件转让土地使用权，是违法行为。
工程款的支付义务：
- 工程款是承包人因完成建设工程而应得的报酬，发包人负有按约定支付工程款的义务。这种义务是基于双方签订的合法有效的建设工程合同而产生的。
二、非法转让土地收益与工程款的关系
收益的非法性：
- 非法转让土地所得的收益，由于转让行为本身违法，因此该收益也具有非法性。在法律上，非法所得通常会被追缴或没收，而不会用于抵偿其他合法债务。
工程款的合法性：
- 工程款是基于合法有效的建设工程合同而产生的合法债务。发包人应按约定支付工程款，这是其法定义务。
三、实际操作与法律后果
无法直接抵偿：
- 由于非法转让土地收益的非法性和工程款的合法性，两者在法律上无法直接抵偿。即使双方有此约定，该约定也可能因违反法律法规的强制性规定而无效。
可能的法律后果：
- 如果非法转让土地行为被发现，相关部门可能会对转让方进行处罚，包括追缴非法所得、罚款等。同时，承包人仍有权要求发包人按约定支付工程款。
四、建议与解决方案
合法转让土地：
- 如果发包人需要转让土地使用权，应确保转让行为符合法律法规的规定，获得必要的批准和许可。
协商解决工程款问题：
- 对于工程款支付问题，双方应首先通过协商解决。如果协商不成，可以依据建设工程合同的约定，通过仲裁或诉讼等法律途径解决。
寻求法律帮助：
- 如果双方在处理非法转让土地收益和工程款问题时遇到法律难题，建议及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。
综上所述，非法转让土地行为的收益由于具有非法性，因此不能直接用于抵偿工程款。双方应遵守法律法规的规定，通过合法途径解决土地转让和工程款支付问题。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。