旅馆业未办理特种行业许可证，将面临行政处罚，具体处罚措施包括责令停业整顿、罚款，情节严重的还可能被吊销许可证或追究刑事责任。以下是详细分析：

1. 行政处罚措施：

   • 责令停业整顿：根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十四条，未经许可擅自经营旅馆业的，公安机关有权责令其停止经营活动。这是为了纠正违法行为，防止未取得合法资质的旅馆继续运营，从而保障公共安全和社会秩序。
   • 罚款：除了责令停业整顿外，公安机关还可以对违法经营者处以罚款。罚款的数额根据违法情节的严重程度而定，一般会在法律规定的范围内进行裁量。
   • 吊销许可证：如果旅馆业在经营过程中存在严重违法行为，如多次未经许可经营、发生重大安全事故等，公安机关在责令停业整顿并罚款的同时，还有权吊销其特种行业许可证，禁止其再次从事旅馆业经营。

2. 情节严重时的刑事责任：

   • 在某些情况下，如果旅馆业未办理特种行业许可证的行为情节特别严重，如涉及非法经营、组织卖淫等违法犯罪活动，那么经营者还可能面临刑事责任的追究。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法经营罪、组织卖淫罪等都有明确的刑罚规定。

3. 其他可能的法律后果：

   • 除了上述行政处罚和刑事责任外，旅馆业未办理特种行业许可证还可能面临其他法律后果。例如，如果旅馆在未经许可的情况下发生安全事故或犯罪活动，经营者可能需要承担民事赔偿责任；同时，其信誉和声誉也会受到严重影响，进而影响其未来的经营和发展。

行动建议：

• 立即停业并补办许可证：如果旅馆业尚未办理特种行业许可证，应立即停止经营活动，并尽快向当地公安机关申请补办许可证。这是避免法律风险和保障合法经营的关键步骤。
• 加强合规管理：在补办许可证的同时，旅馆业应加强内部合规管理，确保所有经营活动都符合法律法规的要求。这包括建立健全的安全管理制度、加强员工培训、定期进行安全检查等。
• 咨询专业律师：在处理此类法律问题时，建议咨询具有相关经验的律师。我可以为你提供专业的法律意见和帮助，确保你的经营活动合法合规。