针对您提出的“旅馆特种行业许可证不合格怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，旅馆业属于特种行业，其经营不仅需要营业执照，还必须获得公安部门核发的《特种行业许可证》。这是确保旅馆业合法、安全经营的重要前提。
如果旅馆的特种行业许可证不合格，或者未经许可擅自经营，那么根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，公安机关将会依法进行查处。具体的处罚措施可能包括：
罚款：对于未经许可擅自经营或者特种行业许可证不合格的旅馆，公安机关有权对其处以罚款。罚款的金额会根据违法行为的严重程度、旅馆的规模以及可能造成的安全隐患等因素来综合确定。例如，在某些案例中，公安机关对未经许可擅自经营的民宿处以了500元的罚款。
取缔：对于存在严重安全隐患或者多次违法经营的旅馆，公安机关除了罚款外，还有权依法取缔该旅馆。取缔意味着该旅馆将被迫停止经营，并可能面临进一步的法律责任。
其他行政处罚：根据违法行为的性质和严重程度，公安机关还可能采取其他行政处罚措施，如警告、责令整改等。
此外，对于旅馆经营者来说，除了面临公安机关的处罚外，还可能因为违法经营而面临其他法律后果，如民事赔偿、行政拘留等。同时，违法经营行为也会严重影响旅馆的声誉和信誉，对旅馆的长期发展造成不利影响。
因此，我建议您作为旅馆经营者，务必确保旅馆的特种行业许可证合法有效，并严格遵守相关法律法规和规章制度。如果发现许可证存在问题或者即将到期，应及时向公安部门申请更换或者续期，以确保旅馆的合法经营和安全运营。
最后，我也希望广大群众在选择住宿场所时，一定要选择手续齐全的正规宾馆、旅店，以保证自己的合法权益不被侵害。同时，如果发现存在非法经营的“黑旅馆”或者特种行业许可证不合格的旅馆，应积极向公安机关举报，共同维护良好的社会治安环境。