打鱼店老板被抓后的处理方式需结合具体案情分析，主要取决于其是否涉嫌违法犯罪及行为性质。以下是不同情形下的处理逻辑：

1. 若涉嫌非法捕捞水产品罪
   根据《刑法》第三百四十条，违反保护水产资源法规，在禁渔区、禁渔期或使用禁用工具捕捞水产品，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或罚金。
   

• 关键情节认定：需结合捕捞时间（是否在禁渔期）、地点（是否在禁渔区）、工具（是否为禁用网具）及数量（是否达到立案标准，如500公斤或价值5000元以上）综合判断。
  
• 处理流程：公安机关立案侦查→检察院审查起诉→法院审判。若证据充分，老板可能被追究刑事责任；若存在自首、立功等情节，可从轻或减轻处罚。

1. 若涉嫌其他犯罪（如销售国家保护水生野生动物）
   若打鱼店销售的是《野生动物保护法》规定的国家重点保护水生野生动物（如中华鲟、胭脂鱼等），可能构成危害珍贵、濒危野生动物罪，根据《刑法》第三百四十一条，处五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
   

• 关键证据：需证明老板明知所售水产品为国家保护物种，且达到立案标准（如价值2万元以上）。

1. 若仅涉及行政违法（如未取得捕捞许可证）
   根据《渔业法》第四十一条，未依法取得捕捞许可证擅自进行捕捞的，没收渔获物和违法所得，并处十万元以下罚款；情节严重的，可没收渔具和渔船。
   

• 处理逻辑：由渔业行政主管部门（如农业农村局）作出行政处罚，不涉及刑事责任，但可能影响店铺经营资质。

1. 若存在程序瑕疵（如证据不足、取证违法）
   根据《刑事诉讼法》第五十五条，定罪需达到“证据确实、充分”标准。若公安机关取证程序违法（如未出示搜查证、未告知权利等），老板可申请排除非法证据，甚至导致案件无法成立。

建议行动：

• 若老板已被采取强制措施（如拘留、逮捕），家属应尽快委托律师会见，了解案情并申请取保候审；
  
• 若案件处于侦查阶段，可向公安机关提交法律意见书，争取不立案或撤销案件；
  
• 若已移送检察院审查起诉，可申请阅卷并提交辩护意见，争取不起诉或量刑协商。
  

具体处理需结合案件细节，如有进一步信息可向我咨询，我会结合证据链和司法实践为您分析。