针对自然村村长想要辞职的情况，虽然您提供的参考信息主要是关于村支部书记的辞职程序，但我们可以借鉴其中的一些通用原则和步骤，并结合自然村村长的实际情况，给出以下建议：

一、明确辞职意愿与准备

自然村村长在决定辞职前，应深思熟虑，明确自己的辞职意愿，并准备好详细的辞职原因说明。这有助于后续与上级组织或相关部门的沟通。

二、提出书面辞职申请

1. 撰写辞职申请：村长需亲自撰写一份书面辞职申请，明确表达辞职意愿，详细说明辞职原因，并预计离职时间。辞职申请应正式、诚恳，并体现出对村级工作的尊重和负责。

2. 提交申请：将辞职申请提交给所在的上级组织，这通常是乡镇政府或相关的农村管理部门。提交时，最好能亲自送达，以确保申请的及时接收和确认。

三、上级组织受理与审批

1. 初步沟通：上级组织在收到辞职申请后，会安排相关人员与村长进行谈话沟通，了解辞职的真实原因，评估辞职对村级工作可能产生的影响，并表达对村长工作的感谢和对其未来发展的祝愿。

2. 组织审批：上级组织会根据村级工作的实际情况和需要，结合村长的辞职申请，进行综合审议。审议过程中，可能会考虑村长的任期、工作表现、村级工作的连续性等因素。

3. 作出决定：经过审议后，上级组织会作出是否批准辞职的决定，并以书面形式通知村长。

四、公示与交接

1. 公示：若辞职申请获得批准，上级组织可能会在村里进行公示，接受村民的监督。公示期通常为几天到一周不等，以确保工作的公开透明。

2. 工作交接：在获得批准和公示无异议后，村长应与继任者或相关工作人员进行全面的工作交接。交接内容包括但不限于村级财务账目、重要文件、未完成的工作任务等。交接过程中，应认真细致，确保村级工作的连续性和稳定性。

五、后续事宜

1. 材料存档：相关的辞职申请、审批文件、公示材料、工作交接清单等资料应由上级组织和村级组织按照规定进行存档，以备后续查阅。

2. 关注村级动态：虽然村长已经辞职，但仍应关注村级工作的动态，为村级发展提供必要的支持和建议。

六、注意事项

• 不同地区对自然村村长的辞职程序可能存在差异，因此在实际操作中，建议咨询当地政府或相关部门以获取准确的辞职程序和要求。
• 村长在辞职时应严格遵守相关法律法规和村级组织的规定，确保辞职过程的合法合规性。
• 工作交接是辞职过程中的重要环节，必须认真细致地进行，以确保村级工作的平稳过渡和村民的利益不受损害。

希望以上建议能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地政府或相关部门。