肇事车辆挂靠的运输公司的追偿权，通常归属于运输公司，但具体情形需依据挂靠协议及实际责任承担情况来确定。以下从不同角度进行详细分析：

1. 挂靠协议的约定：

   • 在挂靠关系中，肇事车辆与运输公司之间通常会签订挂靠协议。这份协议是双方权利义务的基础，其中往往会明确约定在发生交通事故等情形下，责任如何承担以及追偿权的归属。
   • 如果挂靠协议中明确约定了运输公司在承担赔偿责任后享有对肇事车辆或实际车主的追偿权，那么运输公司就有权依据协议进行追偿。

2. 实际责任承担情况：

   • 在交通事故中，如果肇事车辆被认定为全责或主要责任方，且运输公司作为挂靠单位被要求承担连带赔偿责任，那么运输公司在实际支付赔偿款后，有权向肇事车辆或实际车主进行追偿。
   • 追偿的金额通常限于运输公司实际支付的赔偿款，以及因追偿而产生的合理费用（如诉讼费、律师费等）。

3. 法律原则与规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，挂靠单位与被挂靠人之间通常构成连带责任关系。在连带责任中，任何一方都有义务承担全部责任，但承担责任后，有权向其他责任方进行追偿。
   • 具体到交通事故领域，如果运输公司作为挂靠单位被要求承担赔偿责任，且该责任实际上应由肇事车辆或实际车主承担，那么运输公司就有权在承担责任后进行追偿。

4. 特殊情况下的追偿权限制：

   • 如果挂靠协议中未明确约定追偿权，或者约定不明确，那么运输公司的追偿权可能会受到一定限制。此时，需要依据相关法律法规和司法实践来判断运输公司是否享有追偿权以及追偿的范围。
   • 另外，如果肇事车辆或实际车主能够证明运输公司在事故中存在过错（如未尽到安全管理义务等），那么运输公司的追偿权也可能会受到相应影响。

建议：

• 对于运输公司而言，在签订挂靠协议时，应明确约定追偿权的归属和行使条件，以避免后续纠纷。
• 在发生交通事故后，运输公司应及时收集相关证据，如事故认定书、赔偿协议等，以便在追偿时提供有力支持。
• 如果运输公司面临追偿纠纷，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。

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