农业部门本身并不直接具有征用农田并决定拆迁补偿的法定职权，其是否合法需视具体情况及是否符合法定程序而定。以下从多个角度为你详细分析：
一、农业部门的法定职权范围
农业部门主要负责农业、农村和农民相关事务的管理，如农业政策制定、农业技术推广、农村经济发展等。在征地拆迁领域，农业部门通常不是直接的征收主体，也不负责具体的拆迁补偿安置工作。这些工作一般由县级以上人民政府土地行政主管部门（如自然资源部门）负责。
二、征地拆迁的法定程序
根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，征地拆迁必须遵循严格的法定程序，包括：
- 发布征地预公告：由县级以上人民政府发布，告知被征地农村集体经济组织和农户征地的用途、位置、补偿标准等信息。
- 开展土地现状调查：对被征土地的权属、地类、面积以及地上附着物和青苗的种类、数量等进行调查。
- 拟定征地补偿安置方案：由县级以上人民政府土地行政主管部门会同有关部门拟定，并公告征求被征地农村集体经济组织和农户的意见。
- 组织听证：对征地补偿安置方案有异议的，可以申请听证。
- 签订征地补偿安置协议：由县级以上人民政府土地行政主管部门与被征地农村集体经济组织和农户签订。
- 实施征地：在完成上述程序后，由县级以上人民政府组织实施征地，并支付征地补偿费用。
三、农业部门参与征地拆迁的合法性分析
合法参与的情况：
- 如果农业部门在征地拆迁过程中，是受县级以上人民政府委托，协助开展相关工作（如土地现状调查、政策宣传等），且其行为符合法定程序和要求，那么其参与是合法的。
- 如果农业部门在征地拆迁后，负责后续的农业产业发展规划或农村集体经济组织的发展指导等工作，这也是其法定职权范围内的合法行为。
非法参与的情况：
- 如果农业部门未经县级以上人民政府委托，擅自决定征用农田并决定拆迁补偿，这超出了其法定职权范围，是违法的。
- 如果农业部门在征地拆迁过程中，违反法定程序或要求，如未发布征地预公告、未开展土地现状调查、未拟定征地补偿安置方案等，也是违法的。
四、法律建议
- 核实征收主体：如果你对征地拆迁的合法性有疑问，首先应核实征收主体是否为县级以上人民政府土地行政主管部门，以及是否遵循了法定程序。
- 了解补偿标准：你可以要求征收方提供征地补偿安置方案，了解具体的补偿标准和计算方式。
- 寻求法律援助：如果你认为征地拆迁过程中存在违法行为或补偿不合理，可以及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
总之，农业部门本身并不直接具有征用农田并决定拆迁补偿的法定职权。如果你对征地拆迁的合法性有疑问，建议核实征收主体和程序，并了解具体的补偿标准。如有需要，可以随时向我咨询相关法律问题。