劳动合同丢失并不影响员工申请劳动仲裁，关键在于收集其他能证明劳动关系的证据，并按规定程序提交仲裁申请。以下是详细的解答和建议：
一、明确仲裁请求与事实理由
确定仲裁请求：
- 你需要明确想要通过仲裁解决的具体问题，比如是工资争议、加班费争议、解除劳动关系争议，还是其他与劳动合同相关的争议。
梳理事实理由：
- 整理与仲裁请求相关的事实和证据，包括工作时间、工作地点、工作内容、工资支付情况、加班情况等。这些信息将帮助你构建仲裁请求的基础。
二、收集并准备证据材料
尽管劳动合同丢失，但你可以通过其他方式证明劳动关系的存在和争议事实：
证明劳动关系的证据：
- 工资支付记录：如银行流水、工资条等，这些能直接证明你与用人单位之间的经济往来。
- 工作证、服务证：这些证件能证明你的身份和与用人单位的关联。
- 考勤记录：如打卡记录、签到表等，能证明你的工作时间和出勤情况。
- 同事证言：其他同事的证言也能作为证明劳动关系的证据。
- 工作邮件、聊天记录：这些电子证据能证明你与用人单位之间的沟通和工作内容。
- 其他由用人单位掌握管理的证据：根据《劳动争议调解仲裁法》第六条，用人单位应当提供而不提供的，应承担不利后果。
证明争议事实的证据：
- 针对具体仲裁请求，准备相应的证据材料。比如，如果主张加班费，就需要提供加班的证据；如果主张违法解除劳动合同，就需要提供解除劳动合同的证据。
三、提交仲裁申请
撰写仲裁申请书：
- 按照当地仲裁委员会的要求，撰写仲裁申请书。在申请书中，详细陈述仲裁请求、事实和理由，并附上证据清单。
提交申请材料：
- 将仲裁申请书及相关证据材料提交给当地劳动争议仲裁委员会。确保材料的完整性和准确性，以免影响仲裁进程。
等待受理通知：
- 仲裁委员会在收到申请后，会进行审查，并在规定时间内决定是否受理。如果受理，你将收到受理通知和开庭通知。
四、参与仲裁程序
出庭应诉：
- 按照仲裁委员会的通知，准时参加仲裁庭审。这是维护自己权益的重要环节，不可忽视。
陈述事实与理由：
- 在庭审中，清晰、准确地陈述自己的仲裁请求、事实和理由，并提供相关证据。这是仲裁员了解案情、作出裁决的重要依据。
进行辩论与质证：
- 针对用人单位的答辩和证据，进行辩论和质证。这是维护自己合法权益的关键步骤，需要充分准备和积极参与。
五、后续处理
接受仲裁裁决：
- 如果对仲裁裁决结果满意，可以签收仲裁裁决书，并按照裁决结果执行。这是解决争议的一种方式。
提起诉讼：
- 如果对仲裁裁决结果不满意，可以在规定时间内向人民法院提起诉讼。这是进一步维护自己权益的途径。
六、特别提醒
- 及时报案与复印：发现劳动合同丢失后，应及时向公安机关报案，并向公司人事部门报告情况。同时，可向用人单位申请复印留存的劳动合同副本，并加盖印章以证明其真实性。
- 重新签订合同：若条件允许，可与用人单位重新签订新的劳动合同以保障自身权益。这是预防类似纠纷再次发生的有效措施。
总结来说，劳动合同丢失并不是劳动仲裁的障碍。只要你按照上述步骤和注意事项操作，并提供充分证据证明劳动关系存在及相关权益主张，即有可能通过劳动仲裁维护自己的合法权益。如果你在操作过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。