您好，针对您提出的“公务员办营业执照被发现会怎么处理”这一问题，我将结合相关法律法规和纪律要求，为您进行详细解答。
首先，需要明确的是，公务员在职期间是严禁经商办企业的。这一规定源于《中国共产党纪律处分条例》以及中共中央、国务院关于禁止党政机关和党政干部经商、办企业的相关规定。这些规定旨在维护公职人员职务行为的廉洁性，防止公权力与市场利益的不当联结，从而确保公职人员能够全心全意为人民服务。
如果公务员在职期间被发现经商办企业，将会面临以下处理：
纪律处分：根据《中国共产党纪律处分条例》第一百零三条第一款规定，违反有关规定从事营利活动，如经商办企业等，将依据情节轻重给予不同档次的处分，包括警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看直至开除党籍。
经济收益收缴：对于违纪行为所获得的经济利益，应当收缴或者责令退赔。这意味着，公务员通过经商办企业所获得的任何收益，都将被依法追缴。
对于退休公务员经商办企业的情况，也有明确规定：
禁业期限：根据《中华人民共和国公务员法》的规定，公务员辞去公职或者退休后，原系领导成员、县处级以上领导职务的公务员在离职三年内，其他公务员在离职两年内，不得到与原工作业务直接相关的企业或者其他营利性组织任职，不得从事与原工作业务直接相关的营利性活动。
报告与审批：即使退休公务员希望从事与原工作业务不直接相关的营利性活动，也必须事先向原所在单位党委（党组）报告，并按照规定程序进行审批。未经批准擅自从事营利性活动的，同样构成违纪。
退休待遇处理：如果退休公务员在未放弃退休待遇的情况下从事经商办企业活动，根据相关规定，这种行为应当认定为违纪。因为这意味着退休公务员在享受国家提供的退休待遇的同时，还在通过经商办企业获取额外收益，这违反了退休待遇的初衷和规定。
具体案例分析：
以张某为例，他作为A省B市农业农村局的普通公务员，在职期间私下经营物流企业，退休后又未向原单位报告即与他人共同出资注册成立食品公司并担任董事长。张某的行为不仅违反了在职期间禁止经商办企业的规定，也违反了退休后从事营利性活动需报告和审批的规定。因此，张某的行为被认定为违反廉洁纪律，并受到了相应的党纪处分和经济收益收缴。
总结与建议：
作为公务员，无论是在职还是退休后，都应严格遵守相关法律法规和纪律要求，不得从事经商办企业等营利性活动。如果确实有创业或投资的意愿，应当先辞去公职或等到退休后满足相关条件并经过审批后再进行。同时，建议公务员加强学习相关法律法规和纪律要求，提高自身的法律意识和纪律观念，避免因无知而触犯法律红线。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。