结论：在行政诉讼案中，司法鉴定人持有执业证，但司法局未出示登记资料的情况下，执业证的合法有效性需分情况讨论。一般来说，执业证本身若符合法定颁发条件且在有效期内，则具有合法效力；但若登记资料是验证执业证合法性的必要依据，且司法局拒绝出示导致无法验证，则可能影响对执业证合法性的认定。
详细分析：
执业证的合法性基础：
- 司法鉴定人的执业证是其从事司法鉴定活动的法定凭证，其合法性主要取决于颁发程序是否合法、是否符合法定条件以及是否在有效期内。
- 如果执业证是按照相关法律法规的规定，由有权机关依法颁发，且鉴定人符合执业条件，那么该执业证在有效期内是具有合法效力的。
司法局登记资料的作用：
- 司法局的登记资料通常是验证司法鉴定人执业证合法性的重要依据，它记录了鉴定人的基本信息、执业资格、执业经历等关键内容。
- 在行政诉讼中，如果司法局拒绝出示登记资料，可能导致法院无法全面、准确地了解鉴定人的执业情况，从而影响对执业证合法性的认定。
未出示登记资料对执业证合法性的影响：
- 若执业证本身合法有效：即使司法局未出示登记资料，也不能直接否定执业证的合法性。因为执业证的合法性主要取决于其颁发程序和条件，而非登记资料的出示。
- 若登记资料是验证必要依据：在某些情况下，如果登记资料是验证执业证合法性的必要依据，且司法局拒绝出示导致无法验证，那么法院可能会基于证据规则，对执业证的合法性产生合理怀疑，甚至可能不予采信。
行政诉讼中的举证责任：
- 在行政诉讼中，通常由被告（即行政机关）承担举证责任，证明其行政行为的合法性。
- 如果司法局作为被告，拒绝出示登记资料，且该资料对证明执业证的合法性至关重要，那么司法局可能面临举证不能的不利后果。
法律建议：
- 对于鉴定人：如果您的执业证合法有效，但司法局拒绝出示登记资料，您可以向法院说明情况，并提供其他证据证明您的执业资格和合法性。同时，您也可以考虑向司法局提出书面申请，要求其出示登记资料。
- 对于当事人：如果您对鉴定人的执业证合法性有疑问，且司法局拒绝出示登记资料，您可以向法院提出异议，并要求法院责令司法局出示相关证据。同时，您也可以咨询专业律师，了解更多关于行政诉讼和证据规则的法律知识。
可能后果：
- 如果法院最终认定鉴定人的执业证合法有效，那么该鉴定意见将可能被法院采纳作为定案依据。
- 如果法院因司法局拒绝出示登记资料而对鉴定人的执业证合法性产生合理怀疑，并最终不予采信该鉴定意见，那么这可能对案件的审理结果产生重大影响。