下雨天超时3分钟是否免责，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同或协议约定
存在明确约定：如果双方在合同或协议中明确约定了因天气原因（包括下雨）导致的超时可以免责，或者约定了具体的免责条款和条件，那么在这种情况下，下雨天超时3分钟是可以免责的。
无明确约定：如果合同或协议中没有明确约定因天气原因导致的超时可以免责，那么就需要根据其他法律法规和实际情况来判断。
二、法律法规规定
一般原则：在法律法规中，通常没有直接规定下雨天超时可以免责的条款。免责事由一般需要根据具体法律法规和合同条款来确定。
不可抗力：如果下雨天达到了不可抗力的程度（如暴雨、洪水等极端天气），且这种不可抗力是导致超时的直接原因，那么根据《中华人民共和国民法典》中关于不可抗力的规定，当事人可能可以部分或全部免除责任。但需要注意的是，不可抗力的认定需要严格的标准，且需要证明超时与不可抗力之间存在直接的因果关系。
不可抗力认定标准：不可抗力是指不能预见、不能避免且不能克服的客观情况。在判断下雨天是否构成不可抗力时，需要考虑雨势的大小、对交通的影响程度、是否采取了合理的预防措施等因素。
因果关系证明：即使下雨天构成了不可抗力，也需要证明超时与不可抗力之间存在直接的因果关系。例如，如果因为下雨导致道路积水严重，车辆无法通行，从而导致了超时，那么这种情况下超时与不可抗力之间就存在直接的因果关系。
特殊行业规定：对于某些特殊行业（如物流、快递等），可能有相关的行业规定或标准对因天气原因导致的超时进行了规定。在这种情况下，需要参照行业规定或标准来判断是否可以免责。
三、实际情况判断
超时原因：除了下雨天这一因素外，还需要考虑超时是否还有其他原因。例如，如果超时是因为驾驶员自身的原因（如疲劳驾驶、违规操作等），那么即使下雨天也可能不能免责。
影响程度：下雨天对交通的影响程度也是判断是否可以免责的重要因素。如果下雨天对交通的影响较小，且驾驶员没有采取合理的预防措施（如提前出发、选择更优路线等），那么超时可能不能免责。
四、建议与措施
完善合同条款：为了避免因天气原因导致的超时纠纷，建议在合同或协议中明确约定因天气原因导致的超时的处理方式和责任承担。
采取预防措施：在下雨天等可能影响交通的天气条件下，驾驶员应提前了解天气情况，合理规划行程，采取必要的预防措施（如提前出发、选择更优路线、准备防滑设备等），以减少超时的风险。
及时沟通协商：如果因为下雨天等不可抗力原因导致了超时，建议及时与对方沟通协商，说明情况并提供相关证据（如天气预报、交通状况等），以寻求合理的解决方案。