员工自离后，用人单位不发工资的行为在大多数情况下是违法的。不过，具体是否违法还需结合员工的离职行为、公司的相关规定以及是否给公司造成实际经济损失等因素来综合判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 《工资支付暂行规定》第九条：劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
二、违法性分析
工资支付义务：
- 劳动者提供劳动后，有权获得相应的工资报酬。自离只是解除劳动合同的一种方式，并不影响劳动者已经付出劳动所对应的工资权益。
- 用人单位不得因员工自离就随意克扣或拒绝支付工资，除非存在法定扣除情形（如劳动者给用人单位造成经济损失，且扣除需符合法律规定）。
特殊情况下的处理：
- 如果员工在自离前未按照法律规定或公司规章制度提前通知公司，或未完成交接工作，公司可能根据这些违规行为对员工进行处罚，包括合理扣除部分工资。但此扣除需遵循法律规定，不得违反最低工资标准等要求。
- 若员工的自离行为给公司造成了实际经济损失或影响了正常运营，公司有权要求员工承担相应的赔偿责任。赔偿的具体数额和方式应通过协商或法律程序确定，且不得以此为由拒绝支付员工应得的工资。
三、员工自离的常见情形及工资支付方式
未提前通知擅自离职：
- 员工未按规定提前通知用人单位即自行离职。
- 用人单位应结算员工应得的工资，包括基本工资、加班工资等，并按时支付。
- 若因员工自离造成损失，公司可依法另行索赔，但不能以此为由拒付工资。
离职时未办理工作交接：
- 员工离开时未完成工作交接手续。
- 用人单位仍需支付员工工资，并有权要求员工尽快回来办理交接。
- 若员工拒绝办理，用人单位可通过法律途径解决，但不得以此为由拒绝支付工资。
四、员工的维权途径
若公司因员工自离而不发工资，员工可采取以下合法途径维权：
- 与公司协商：首先尝试与公司进行协商解决，要求公司发放应得工资。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司限期支付工资。
- 申请劳动仲裁：若问题仍未解决，员工可申请劳动仲裁，通过仲裁程序来维护自己的合法权益。
五、建议与提醒
- 对于员工：尽管自离不影响工资获取的基本权利，但为了避免不必要的法律纠纷和经济损失，建议劳动者在离职时尽量按照法律规定的程序进行，如提前通知、完成交接等。同时，保留好相关证据，如工作记录、考勤表、工资条等，以备不时之需。
- 对于公司：公司应制定明确的规章制度，规范员工的离职流程和工资支付事宜。在处理员工自离问题时，应遵循相关法律法规，确保处理方式的合法性和合理性。若员工自离给公司造成损失，应通过合法途径进行索赔，而非直接扣发工资。
综上所述，员工自离后，公司应当依法支付其应得的工资。如果公司违反这一规定，员工有权通过法律途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。