结论：农村邻里之间互换土地后，土地性质改变，村委按照互换土地登记确权是否合法，需根据具体情况判断，若互换行为合法且符合相关程序，村委的确权行为通常是合法的；若互换行为存在违法情形或程序瑕疵，则村委的确权行为可能不合法。以下从不同角度进行分析：
合法情形
互换行为合法且程序正当：
- 根据《中华人民共和国农村土地承包法》第三十四条：“经发包方同意，承包方可以将全部或者部分的土地承包经营权转让给本集体经济组织的其他农户，由该农户同发包方确立新的承包关系，原承包方与发包方在该土地上的承包关系即行终止。” 这表明，在符合法律规定且经过发包方（通常是村委会）同意的情况下，农村土地承包经营权可以在本集体经济组织成员之间互换。
- 若邻里之间的土地互换行为已经得到了村委会的同意，并且双方签订了书面互换合同，明确了互换的土地范围、期限、权利义务等条款，同时办理了相关的登记手续，那么这种互换行为就是合法的。
- 在土地性质改变后，如果这种改变是合法的（例如，由于规划调整或政策变化导致土地用途变更），并且村委会在确权时遵循了相关法律法规和政策规定，那么村委会按照互换土地登记确权的行为就是合法的。
符合当地习惯和政策：
- 在一些地区，农村邻里之间互换土地是一种常见的做法，且得到了当地政府和村民的广泛认可。如果这种互换行为符合当地的习惯和政策，并且没有违反法律法规的强制性规定，那么村委会在确权时通常会予以确认。
不合法情形
互换行为违法或程序瑕疵：
- 如果邻里之间的土地互换行为没有得到村委会的同意，或者双方没有签订书面互换合同，或者互换合同存在违法条款（如违反土地用途管制规定），那么这种互换行为就是违法的或存在程序瑕疵。
- 在这种情况下，即使土地性质发生了改变，村委会也不能简单地按照互换土地登记确权。因为这种确权行为可能缺乏法律依据或程序正当性，容易引发纠纷和争议。
土地性质改变违法：
- 如果土地性质的改变是违法的（例如，未经批准擅自改变土地用途），那么这种改变本身就是无效的。在这种情况下，村委会不能按照违法的土地性质进行确权登记。
- 村委会在确权时应当严格遵守相关法律法规和政策规定，确保土地性质的合法性和准确性。如果发现土地性质改变违法，应当及时报告相关部门进行处理，而不是擅自进行确权登记。
法律建议
- 对于村民：在进行土地互换时，务必确保互换行为的合法性和程序正当性。建议签订书面互换合同，并明确双方的权利义务和违约责任。同时，及时办理相关的登记手续，以确保自己的权益得到保障。
- 对于村委会：在确权时应当严格遵守相关法律法规和政策规定，确保确权行为的合法性和准确性。如果发现土地互换行为存在违法情形或程序瑕疵，应当及时报告相关部门进行处理，而不是擅自进行确权登记。
总结：农村邻里之间互换土地后土地性质改变，村委按照互换土地登记确权的合法性取决于互换行为的合法性和程序正当性以及土地性质改变的合法性。如果互换行为合法且程序正当，且土地性质改变合法，那么村委会的确权行为通常是合法的；反之，则可能不合法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。