农村自建房长期租赁在符合一定条件下是合法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律背景与规定
租赁期限限制：
- 根据《中华人民共和国民法典》第七百零五条的规定，租赁期限不得超过二十年。超过二十年的，超过部分无效。这意味着，农村自建房的长期租赁合同，其最长期限不得超过二十年，否则超出部分将不受法律保护。
土地性质与用途：
- 农村自建房通常建立在宅基地上，宅基地属于农村集体所有，农民个人只有使用权，没有所有权。因此，在租赁农村自建房时，必须确保土地用途符合宅基地的使用规定，即用于居住用途，不得擅自改变土地用途，如用于商业开发等。
合同签订与备案：
- 租赁农村自建房时，双方应签订书面租赁合同，明确租赁期限、租金、支付方式、维修责任等条款。虽然法律并未强制要求租赁合同必须备案，但备案可以增强合同的法律效力，有助于在发生纠纷时维护双方权益。
合法性判断要点
租赁期限合规性：
- 确保租赁期限不超过二十年，这是判断农村自建房长期租赁合法性的首要条件。如果租赁期限超过二十年，超出部分将被视为无效，可能导致租赁双方权益受损。
土地用途合规性：
- 租赁的农村自建房必须用于居住用途，不得擅自改变土地用途。如果承租人将房屋用于非居住用途，如开设工厂、商店等，将可能面临法律制裁，同时出租人也可能因未尽到监管责任而承担连带责任。
合同条款明确性：
- 租赁合同应明确双方的权利和义务，包括租赁期限、租金、支付方式、维修责任等。合同条款的明确性有助于减少纠纷的发生，并在纠纷发生时提供有力的法律依据。
法律建议与风险提示
签订书面合同：
- 无论租赁期限长短，都建议签订书面租赁合同，以明确双方的权利和义务。书面合同具有更强的法律效力，有助于在发生纠纷时维护双方权益。
了解土地性质与用途：
- 在租赁农村自建房前，应了解土地的性质和用途，确保租赁行为符合法律法规的规定。如果土地用途不符合居住用途，或者存在其他限制条件，应谨慎考虑租赁事宜。
及时咨询与维权：
- 如果在租赁过程中遇到纠纷或问题，应及时咨询专业律师或相关部门，了解自己的权益和义务，并采取合适的措施进行维权。
总结来说，农村自建房长期租赁在符合租赁期限、土地用途和合同条款等条件下是合法的。然而，由于农村土地和房屋的特殊性，租赁双方在签订合同时应格外谨慎，确保合同内容合法合规，以维护自己的合法权益。如果你在农村自建房租赁方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。