结论：在美容院做手术出现问题，法院建议起诉其上级公司的情况下，您应当首先确认美容院与其上级公司之间的法律关系，并据此准备相关证据材料，按照法院的指导进行诉讼。以下是对此问题的详细分析：
一、确认法律关系
美容院与上级公司的关系：
- 您需要首先明确美容院与其上级公司之间的法律关系。这通常涉及到合同关系、加盟关系、直营关系等。不同的法律关系将影响您起诉的对象和诉讼策略。
- 如果美容院是上级公司的分支机构或直营店，那么上级公司通常需要承担美容院的法律责任。
- 如果美容院是上级公司的加盟店，那么情况可能更为复杂，需要查看加盟合同中的责任划分条款。
收集相关证据：
- 收集与美容院手术相关的所有证据，包括手术合同、付款凭证、手术前后的照片、医疗记录、证人证言等。
- 如果可能，获取美容院与其上级公司之间的合同或协议，以了解它们之间的法律关系和责任划分。
二、按照法院指导进行诉讼
起诉对象：
- 根据法院的建议，您可能需要起诉美容院的上级公司。这通常是因为法院认为上级公司对美容院的行为负有法律责任。
- 如果您认为美容院本身也应承担责任，可以在起诉状中同时列明美容院和其上级公司为共同被告，或者根据法院的指导进行相应调整。
诉讼策略：
- 在准备诉讼材料时，要突出上级公司对美容院的管理、监督或支持责任，以及这些责任如何与您的损害结果相关联。
- 如果上级公司存在过错或疏忽，如未对美容院进行必要的培训、监督或管理，导致手术出现问题，那么上级公司应承担相应的法律责任。
遵循诉讼程序：
- 按照法院的指导，提交起诉状和相关证据材料。
- 参加庭审，陈述事实，提供证据，并回答法院和对方当事人的提问。
- 尊重法院的判决，如果不服判决，可以在法定期限内提起上诉。
三、其他注意事项
法律咨询：
- 在整个诉讼过程中，如果您有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。
保留证据：
- 无论诉讼结果如何，都要妥善保留所有与案件相关的证据材料。这些证据可能在未来的执行阶段或相关纠纷中发挥重要作用。
关注诉讼时效：
- 注意诉讼时效的问题，确保在法定期限内提起诉讼。如果超过诉讼时效，您可能会失去胜诉权。
最后，面对美容院手术出现问题的情况，您需要保持冷静，收集证据，并按照法院的指导进行诉讼。如果您在整个过程中有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。我会尽我所能为您提供专业的法律支持。