可以起诉。在军人同意离婚但对子女抚养权有异议的情况下，完全可以通过法律途径来解决抚养权的争议。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。当双方对抚养权产生争议时，可以通过诉讼的方式，由法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。

诉讼流程

1. 准备材料：起诉前，需要准备好相关的证据材料，如身份证明、结婚证、子女出生证明、双方经济状况证明、子女生活环境证明等，以证明自己更适合抚养子女。

2. 提交起诉状：向有管辖权的法院提交起诉状，明确诉讼请求，即要求获得子女的抚养权，并陈述事实和理由。

3. 法院审理：法院在受理案件后，会安排开庭审理。在审理过程中，双方可以陈述自己的意见和提供证据。法院会根据子女的权益和双方的具体情况，如经济能力、生活环境、教育条件等，进行综合判断。

4. 判决与执行：法院审理结束后，会作出判决。如果判决你获得抚养权，对方需要履行判决，将子女交由你抚养。如果对方不履行判决，你可以向法院申请强制执行。

特殊情况考虑

• 军人身份：虽然一方是军人，但这并不影响抚养权的判决。法院在判决时，会主要考虑子女的权益和双方的具体情况，而不是单纯基于军人的身份。

• 子女意愿：如果子女已满八周岁，法院在判决时还会考虑子女的意愿。子女愿意跟随哪一方生活，也是法院判决的重要参考因素。

法律建议

1. 积极收集证据：在起诉前，积极收集有利于自己获得抚养权的证据，如经济能力证明、生活环境证明、教育条件证明等。

2. 尊重子女意愿：如果子女已满八周岁，要尊重子女的意愿，并与子女进行充分的沟通，了解子女的想法和需求。

3. 寻求专业帮助：在诉讼过程中，可以寻求专业律师的帮助，以更好地维护自己的权益和子女的权益。

作为雷俊律师，我专注于婚姻家庭领域的法律事务，如果你在抚养权争议方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。