两人合伙开公司时，打款应明确款项性质并备注清晰，具体建议如下：

1. 明确款项性质
   在打款时，首先需明确该笔款项是“投资款”还是“借款”。

   • 若为投资款：即股东对公司的出资，应备注“投资款”或“股权出资”。此时，款项将转化为公司的注册资本或资本公积，股东按出资比例享有股权。
     
   • 若为借款：即股东临时借给公司的资金，应备注“借款”并明确还款期限、利息（如有）。此时，公司需按约定还款，股东与公司形成债权债务关系。
     

2. 备注关键信息
   无论款项性质如何，打款时均需备注以下信息，以避免后续纠纷：

   • 打款人姓名：与股东身份一致；
     
   • 收款方名称：公司全称，确保与营业执照一致；
     
   • 用途：如“投资款-张三出资”或“借款-李四临时周转”；
     
   • 日期：打款具体日期，与银行流水对应。
     

3. 配套法律文件
   仅备注款项性质和用途可能不足，建议同步签订书面协议：

   • 若为投资款：需签订《股东协议》或《公司章程》，明确出资方式、股权比例、分红规则等；
     
   • 若为借款：需签订《借款合同》，明确借款金额、期限、利息、还款方式等。
     

4. 财务与税务处理

   • 投资款：需计入公司实收资本或资本公积，并依法完成工商变更登记（如增资）；
     
   • 借款：公司需按约定支付利息（若约定），利息支出需取得合法票据（如发票）方可税前扣除。
     

风险提示：若打款时未明确款项性质或未签订书面协议，后续可能因股权确认、债务清偿等问题产生纠纷。例如，股东主张出资但未备注“投资款”，可能被认定为借款，影响股权比例；或公司主张借款但未签合同，可能被认定为赠与，需无偿还款。

如有进一步疑问（如协议条款设计、税务优化等），可直接向我咨询。