分包单位法人授权书签协议是否有效，这主要取决于授权书的合法性和协议内容是否符合法律规定。以下从几个方面进行详细分析：

1. 授权书的合法性：

   • 法人资格：首先，需要确认分包单位是否具备法人资格。只有具备法人资格的单位才能出具有效的法人授权书。
   • 授权内容：授权书应明确授权的范围、期限以及被授权人的权限等。如果授权书内容模糊、不明确或者超出法人权限范围，那么该授权书可能被视为无效。
   • 签署程序：授权书应由分包单位的法定代表人签署，并加盖单位公章。如果签署程序不符合规定，如非法定代表人签署或未加盖公章，那么授权书的效力可能会受到质疑。

2. 协议内容的合法性：

   • 协议条款：即使授权书有效，协议的内容也必须符合法律规定。如果协议中存在违法条款，如违反强制性法律规定、损害社会公共利益等，那么该协议可能被视为无效。
   • 双方意思表示：协议的签订必须是双方真实意思的表示。如果存在欺诈、胁迫等情形，导致一方意思表示不真实，那么该协议也可能被视为无效。

3. 实际履行情况：

   • 履行行为：协议的效力不仅取决于其形式上的合法性，还取决于双方的实际履行情况。如果双方已经按照协议约定履行了各自义务，且没有违反法律规定，那么该协议通常会被视为有效。
   • 争议解决：如果在履行过程中发生争议，双方应首先通过协商解决。如果协商不成，可以依据协议中的争议解决条款或者相关法律规定，通过诉讼或仲裁等方式解决。

建议：

• 在签订协议前，务必确认分包单位的法人资格和授权书的合法性。
• 仔细审查协议内容，确保条款合法、明确，并符合双方真实意思表示。
• 在履行协议过程中，保留好相关证据，以备不时之需。

可能后果：

• 如果授权书或协议内容存在违法情形，可能导致协议无效，双方需承担相应的法律责任。
• 如果因授权书或协议问题引发争议，可能涉及诉讼或仲裁等法律程序，增加双方的时间和成本投入。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。