结论：国家机关工作人员28年前超生未被发现，在今天是否会被处罚，需结合具体情况分析，但通常情况下，由于已过行政处罚的追责时效，可能不再予以处罚。
分析：
行政处罚的追责时效：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条：“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。”
- 在本案例中，超生行为发生在28年前，远超过了行政处罚法规定的二年（或五年，如涉及特定领域）的追责时效。因此，从法律程序上讲，由于已过追责时效，行政机关通常不再对超生行为进行处罚。
特殊情况考虑：
- 尽管存在追责时效的规定，但需注意是否存在法律、行政法规或地方性法规对超生行为的处罚有特别规定，且这些规定是否设定了更长的追责时效或不受追责时效限制。然而，在现行法律体系中，并未发现此类特别规定。
- 另外，如果超生行为在当时或后续造成了特定的社会影响或危害后果，且这些后果在今天仍然存在或持续，理论上行政机关可能基于公共利益或社会管理的需要，考虑采取一定的措施。但这种情况较为罕见，且需严格依法进行。
实际执行中的考量：
- 在实际操作中，由于时间久远，相关证据可能已灭失或难以收集，行政机关在调查和处罚时可能面临诸多困难。
- 同时，考虑到社会观念的变化和计划生育政策的调整，行政机关在处理此类历史遗留问题时，通常会更加审慎和灵活。
建议：
- 对于国家机关工作人员而言，如果确实存在28年前的超生行为且未被发现，从法律程序上讲，由于已过追责时效，通常不再予以处罚。但建议保持诚信，遵守法律法规，避免任何可能引发法律纠纷的行为。
- 如果对具体法律问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。