对于在违法建筑内开设超市的处罚问题，主要涉及对违法建筑本身的处置以及对超市经营行为的规制两方面，具体处罚需结合实际情况，依据相关法律法规综合判定。以下分情况详细说明：

1. 针对违法建筑本身的处罚

   • 责令限期拆除或改正：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。若该超市所在建筑属于此类违法建筑，将面临上述处罚。
   • 强制拆除：若违法建筑严重影响城市规划，且无法通过改正措施消除影响，相关部门有权依法强制拆除。在强制拆除前，通常会给予一定的自行拆除期限，逾期未拆的，将实施强制拆除。

2. 针对超市经营行为的处罚

   • 停业整顿或关闭：若超市在违法建筑内持续经营，且未取得合法的经营许可（如营业执照、食品经营许可证等），市场监管部门有权责令其停业整顿，直至取得合法经营资格或关闭。
   • 罚款：根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》等相关法律法规，对于未依法取得营业执照而从事经营活动的，由登记机关责令改正，没收违法所得；拒不改正的，处1万元以上10万元以下的罚款；情节严重的，依法责令关闭停业，并处10万元以上50万元以下的罚款。若超市存在此类违法行为，将面临相应罚款。
   • 其他行政处罚：若超市在违法建筑内经营过程中存在其他违法行为（如销售假冒伪劣商品、违反消防安全规定等），还将面临相关法律法规规定的行政处罚。

建议：若您或他人面临此类情况，建议立即停止在违法建筑内的经营活动，并积极与相关部门沟通，了解违法建筑的具体处置方案及超市经营行为的整改要求。同时，寻求专业法律帮助，以确保自身权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。