在扣劳动者工资的举证责任问题上，一般遵循“谁主张，谁举证”的原则，但具体举证责任的分配会根据实际情况有所不同。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
用人单位主张扣工资的情况：
- 举证责任在用人单位：如果用人单位主张因劳动者原因（如旷工、迟到、早退、违反公司规章制度等）需要扣除工资，那么用人单位需要承担举证责任。这通常意味着用人单位需要提供相关的考勤记录、规章制度、劳动者违规的证据等，以证明其扣工资的合法性和合理性。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条：“发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。”因此，在扣工资争议中，如果相关证据由用人单位掌握管理，如考勤记录、工资单等，用人单位有义务提供这些证据。
劳动者主张被非法扣工资的情况：
- 初步举证责任在劳动者：劳动者如果主张用人单位非法扣除了其工资，首先需要提供一些初步的证据，如工资条、银行转账记录等，以证明其原本应得的工资数额以及实际收到的工资数额存在差异。
- 举证责任转移：在劳动者提供了初步证据后，如果用人单位否认扣工资或主张扣工资有合法依据，那么举证责任就转移到了用人单位身上。用人单位需要提供证据证明其扣工资的合法性和合理性，如上述提到的考勤记录、规章制度等。
特殊情况下的举证责任：
- 因客观原因不能自行收集的证据：如果劳动者因客观原因（如证据由用人单位掌握、劳动者无法接触等）不能自行收集相关证据，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会或法院申请调查取证。在这种情况下，劳动争议仲裁委员会或法院会根据具体情况决定是否进行调查取证，并可能要求用人单位提供相关证据。
- 用人单位拒不提供证据：如果用人单位在劳动争议处理过程中拒不提供其掌握管理的相关证据，劳动争议仲裁委员会或法院可以依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，对用人单位作出不利的裁决或判决。
法律建议：
- 对于劳动者而言，如果发现用人单位非法扣除了其工资，应及时收集相关证据（如工资条、银行转账记录、考勤记录等），并向用人单位提出异议或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 对于用人单位而言，如果需要扣除劳动者工资，应确保有合法依据和合理理由，并妥善保存相关证据（如考勤记录、规章制度、劳动者违规的证据等），以备在劳动争议处理过程中提供。
可能法律后果：
- 如果用人单位无法提供合法依据和合理理由来证明其扣工资的合法性和合理性，劳动争议仲裁委员会或法院可能会裁决用人单位向劳动者支付被扣除的工资及可能的赔偿金。
- 如果劳动者无法提供初步证据来证明其被非法扣工资的情况，且用人单位能够提供合法依据和合理理由来证明其扣工资的合法性和合理性，那么劳动者的主张可能会得不到支持。