结论：集体土地上厂房建筑超过二十年是否算违建，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 从土地性质和规划许可的角度：

   • 集体土地上的建筑，如果未经规划部门批准，未取得建设工程规划许可证或乡村建设规划许可证，即使存在超过二十年，也可能被认定为违建。因为规划许可的缺失是判断建筑合法性的关键因素之一。
   • 如果厂房建筑在建设时已经取得了相应的规划许可，并且符合当时的规划要求，那么即使存在超过二十年，也不应被直接认定为违建。但需要注意的是，如果后续规划发生了变化，且该建筑未按照新的规划要求进行改造或拆除，那么可能面临违建的风险。

2. 从建筑安全和使用功能的角度：

   • 即使厂房建筑在建设时取得了规划许可，但如果经过长时间的使用，建筑结构出现老化、损坏，或者存在安全隐患，且未进行必要的维修和加固，那么该建筑可能因不符合安全标准而被认定为违建或需要限期整改。
   • 另外，如果厂房建筑的使用功能发生了变化，且未按照相关规定进行变更登记或重新取得规划许可，那么该建筑也可能因使用功能不符而被认定为违建。

3. 从历史遗留问题和政策变化的角度：

   • 对于一些历史遗留的集体土地上的厂房建筑，由于当时法律法规不完善或执行不严格，可能存在未取得规划许可或手续不全的情况。对于这类建筑，政府可能会根据实际情况制定相应的政策进行处理，如补办手续、罚款后保留等。
   • 随着法律法规的完善和政策的变化，对于集体土地上的建筑管理也越来越严格。因此，即使厂房建筑存在超过二十年，也需要关注最新的政策动态和法律法规要求，以避免因政策变化而被认定为违建。

建议：

• 如果您是厂房建筑的所有者或使用者，建议您首先查阅该建筑的建设手续和相关规划许可文件，了解其合法性情况。
• 如果发现该建筑存在手续不全或不符合规划要求的情况，建议您及时咨询当地规划部门或相关政府部门，了解补办手续或整改的具体要求和流程。
• 同时，您也可以关注最新的政策动态和法律法规要求，以便及时调整自己的经营策略和管理方式，避免因政策变化而带来的风险。

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