结论：公司诈骗套取国家农机补贴金额达九十万元，法人作为直接负责的主管人员或其他直接责任人员，将面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或没收财产。
具体分析：
行为性质与法律定性：
- 套取国家农机补贴款的行为，本质上是通过虚构事实、隐瞒真相等手段骗取国家财产，符合诈骗罪的构成要件。
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百六十六条，诈骗公私财物，数额特别巨大的，将面临严厉的刑事处罚。
数额认定与量刑标准：
- 根据相关司法解释，诈骗公私财物价值五十万元以上的，应当认定为“数额特别巨大”。
- 在本案例中，诈骗金额达九十万元，远超“数额特别巨大”的标准，因此将面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或没收财产的严厉处罚。
- 量刑计算公式（虽非严格数学公式，但为说明量刑幅度）：
- 基础刑期：十年以上有期徒刑或无期徒刑
- 罚金：根据犯罪情节和财产状况确定，可能包括没收财产
法人责任与量刑考量：
- 法人作为公司的直接负责的主管人员或其他直接责任人员，将对公司诈骗行为承担刑事责任。
- 法院在判决时，会综合考虑犯罪手段、退赃情况、认罪态度、前科记录等因素。若法人存在自首、立功、积极退赃等从轻情节，可能酌情减轻刑罚；反之，若存在多次作案、造成严重后果等加重情节，则可能面临更严厉的处罚。
社会危害性与政策影响：
- 农业补贴是国家支持农业发展、保障粮食安全的重要政策工具。套取补贴款不仅侵害了国家财产安全，还破坏了农业补贴政策的公平性和有效性。
- 法人的诈骗行为可能对其他符合条件的农户造成不公平竞争，影响国家财政资金的合理使用，因此社会危害性较大，这也是法院在量刑时会予以考虑的因素。
建议与后续行动：
- 若法人或公司面临此类指控，应立即寻求专业律师的帮助，以便全面评估案情、制定辩护策略。
- 积极配合调查，如实供述罪行，争取从轻处理。
- 主动退还违法所得，以减轻社会危害性和法院的量刑考虑。
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