在招投标过程中，若发现三家公司的预算清单由同一人制作，这通常构成串通投标行为，会面临相应的行政处罚，情节严重的还可能承担刑事责任。具体分析如下：

1. 行政处罚：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条的规定，投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，或者投标人以向招标人或者评标委员会成员行贿的手段谋取中标的，中标无效。同时，行政监督部门会处以中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款。
   • 在此情况下，三家公司的预算清单由同一人制作，明显属于相互串通投标的行为，因此会受到上述行政处罚。

2. 其他后果：

   • 除了行政处罚外，串通投标的行为还可能导致相关单位和个人被列入不良行为记录名单，并在一定期限内禁止参加依法必须进行招标的项目的投标。
   • 如果串通投标行为情节严重，触犯了《中华人民共和国刑法》第二百二十三条的规定，即投标人相互串通投标报价，损害招标人或者其他投标人利益，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。此时，相关责任人员还可能面临刑事责任的追究。

建议：

• 对于参与招投标活动的各方主体，应严格遵守相关法律法规，确保招投标活动的公平、公正和公开。
• 如果发现串通投标等违法行为，应及时向行政监督部门举报，以维护招投标市场的良好秩序。
• 对于已经受到行政处罚或刑事追究的单位和个人，应认真吸取教训，加强内部管理，防止类似行为再次发生。

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