在保护区原有的地基上修建建筑物是否构成违法，这主要取决于该保护区的具体性质、管理规定以及修建行为是否获得了相关部门的批准。以下从几个关键角度进行分析：
保护区的性质与管理规定：
- 保护区通常分为自然保护区、风景名胜区、文化遗产保护区等多种类型，每种保护区都有其特定的管理规定和保护目标。
- 在自然保护区或风景名胜区内，修建建筑物往往受到严格限制，甚至完全禁止，以保护自然景观或文化遗产的完整性和原始性。
- 如果该地基位于此类严格限制或禁止建设的保护区内，且未获得特殊批准，那么修建建筑物很可能构成违法。
修建行为的合法性：
- 即使地基位于保护区内，如果修建行为获得了相关部门的批准，如规划许可、建设许可等，并且符合保护区的整体规划和保护要求，那么该修建行为可能是合法的。
- 然而，如果未经批准擅自修建，或者修建行为违反了保护区的相关规定，如建筑高度、风格、材料等限制，那么该行为很可能被视为违法。
法律后果：
- 如果修建行为被认定为违法，可能会面临一系列法律后果，包括但不限于责令停止建设、限期拆除、罚款等。
- 在某些情况下，如果修建行为对保护区造成了严重破坏，还可能涉及刑事责任。
针对您的情况，我建议：
- 首先确认保护区的具体性质和管理规定：了解该保护区是否允许修建建筑物，以及修建需要满足哪些条件。
- 然后检查修建行为是否获得了相关部门的批准：如果未获得批准，应立即停止建设，并咨询相关部门了解补办手续的可能性。
- 如果修建行为已经获得批准，但可能违反保护区的其他规定：应尽快与相关部门沟通，了解如何调整修建方案以满足规定要求。
最后，需要强调的是，保护区的保护工作至关重要，任何修建行为都应谨慎对待，确保符合保护区的整体规划和保护要求。如果您对保护区的相关规定或修建行为的合法性有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。