核心结论：土地被侵权且证件丢失时，您需要分两步处理——先补办土地权属证件，再通过法律途径维权。以下是具体操作建议：

一、补办土地权属证件是维权的前提

土地权属证件（如《集体土地使用证》《国有土地使用证》等）是证明土地归属的核心材料，丢失后需立即补办，否则可能因证据不足导致维权受阻。具体流程如下：

1. 登报声明作废
   在当地市级以上报纸刊登证件遗失声明（需写明土地位置、证号、权利人姓名等信息），保留刊登的报纸原件作为后续补办依据。

2. 向发证机关申请补办

   • 农村土地：向乡镇国土资源所或县级自然资源局提交补办申请，需提供身份证、户口本、土地权属来源证明（如承包合同、分家协议等）、登报声明等材料。
     
   • 城市国有土地：向不动产登记中心申请补办，需提供身份证、购房合同/赠与协议等权属来源材料、登报声明等。
     注：若原证件有抵押、查封等限制，需先解除限制再补办。

3. 配合调查与公示
   发证机关会核查土地权属历史档案，并在村/社区公示补办信息（通常15个工作日），无异议后核发新证。

二、土地侵权维权的具体路径

补办证件后，可根据侵权情况选择以下方式维权：

1. 协商解决
   直接与侵权方沟通，要求停止侵害（如停止占用、拆除违建等）并赔偿损失。建议保留书面协商记录（如微信聊天记录、录音等），避免口头协商无凭证。

2. 行政投诉
   向当地自然资源局或农业农村局举报，要求行政机关介入调查并责令侵权方整改。例如：

   • 非法占用土地：依据《土地管理法》第77条，可要求责令退还土地、拆除违建；
     
   • 破坏土地：依据《土地管理法》第75条，可要求责令限期改正或治理。

3. 民事诉讼
   若协商、行政投诉无果，可向法院起诉，主张：

   • 停止侵害：要求侵权方立即停止占用、破坏土地；
     
   • 排除妨碍：要求拆除违建、恢复土地原状；
     
   • 赔偿损失：按实际损失（如土地收益减少、修复费用等）主张赔偿。
     需提供证据：补办后的土地证、侵权现场照片/视频、损失计算依据等。

4. 刑事报案（严重情况）
   若侵权行为涉嫌犯罪（如故意毁坏财物罪、非法占用农用地罪），可向公安机关报案。例如：

   • 非法占用基本农田5亩以上或基本农田以外的耕地10亩以上，可能构成非法占用农用地罪；
     
   • 故意毁坏土地价值5000元以上，可能构成故意毁坏财物罪。

三、关键提醒

1. 及时固定证据：土地被侵权时，立即拍照、录像记录现场情况，并保存侵权方身份信息（如身份证号、联系方式）。
   
2. 避免自行冲突：维权时保持理性，避免与侵权方发生肢体或语言冲突，防止被反诉“侵权”。
   
3. 专业协助：土地纠纷涉及法律程序复杂，若对补办流程或维权策略不熟悉，可随时向我咨询，我会根据您的具体情况制定方案。

总结：土地被侵权且证件丢失时，先补办证件以明确权属，再通过协商、行政投诉或诉讼维权。每一步都需保留证据，必要时可委托律师介入。如有进一步疑问，欢迎直接向我提问。