国有企业解除违反劳动合同的员工的劳动关系，必须严格遵循法定程序，确保过程合法、公正且透明。具体程序如下：
一、协商解除劳动合同（若适用）
虽然用户询问的是企业单方解除的情况，但协商解除作为一种可能的解决方式，也值得简要提及：
- 提出解除动议：企业或员工任一方可提出解除劳动合同的意向，明确原因和时间安排。
- 双方协商：就解除条件进行充分沟通，包括经济补偿、工作交接等事宜。
- 签订解除协议：达成一致后，签订书面协议，详细列明解除日期、补偿金额等条款。
- 办理离职手续：员工完成工作交接，企业出具解除证明，并办理档案和社保转移。
二、企业单方解除劳动合同（针对违反劳动合同的员工）
（一）过失性辞退
当员工严重违反企业规章制度或失职时，企业可采取过失性辞退：
调查取证：
- 企业需收集员工严重违反规章制度或失职的证据，如违纪记录、视频资料、证人证言等。
- 证据应确凿、充分，能够证明员工的过错行为。
认定事实：
- 依据企业规章制度和法律法规，确认员工的过错行为是否构成严重违反规章制度或失职。
通知工会：
- 企业应事先将解除理由通知工会，听取工会意见。若企业未建立工会，则需征求职工代表意见。
作出解除决定：
- 企业应以书面形式作出解除劳动合同的决定，明确解除原因、依据和日期。
- 决定书应送达员工本人，并要求签收。若员工拒绝签收，企业可采用邮寄、公告等方式送达。
办理离职手续：
- 员工应完成工作交接，企业出具解除劳动合同证明书，明确解除日期和原因。
- 企业应在十五日内为员工办理档案和社会保险关系转移手续。
（二）通用步骤与注意事项（在过失性辞退中同样适用）
明确解除事由：
- 企业应确保解除事由符合法律法规规定，如员工严重违规、严重失职等。
- 解除事由应具体、明确，避免模糊或歧义。
严格遵守法律程序：
- 企业在整个解除过程中需严格遵守《劳动法》及《劳动合同法》的相关规定。
- 确保每一步都合法合规，避免侵犯员工的合法权益。
出具解除证明：
- 解除后，企业应向员工出具解除劳动合同证明书，明确解除日期和原因。
- 证明书应加盖企业公章，具有法律效力。
经济补偿（如适用）：
- 在过失性辞退中，若员工无过错或过错轻微，企业可能需依法支付经济补偿金。
- 经济补偿金的标准根据员工的工作年限和工资水平确定。但在此类情况下，通常员工因严重过错被辞退，企业无需支付经济补偿。不过，具体还需根据企业规章制度和实际情况判断。
备案与记录：
- 企业应将解除情况进行备案，并在相关记录中注明解除原因、日期等关键信息。
- 备案和记录应妥善保存，以备后续查询和审计。
沟通与协商（尽管是单方解除，但仍建议）：
- 尽管是企业单方解除劳动合同，但企业仍应重视与员工的沟通。
- 通过沟通解释解除原因和依据，减少纠纷和误解的发生。
总结与建议：国有企业在解除违反劳动合同的员工的劳动关系时，应严格按照法定程序操作，确保每一步都合法合规。同时，注重与员工的沟通和协商，尽量通过平和的方式解决问题。若遇到复杂或疑难情况，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律指导。你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。