针对您提出的“虚开增值税专用发票40万怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，虚开增值税专用发票是一项严重的经济犯罪行为，它直接损害了国家的税收利益，破坏了税收征管的正常秩序。对于此类行为，我国法律有着明确的处罚规定。

一、基本量刑幅度

根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，对于虚开增值税专用发票的行为，若情节相对较轻，将处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金。然而，这一基本量刑幅度主要适用于虚开税款数额较小或情节相对轻微的情况。

二、针对您问题的具体分析

在您的情况下，虚开增值税专用发票的税款数额为40万。虽然这一数额并未直接达到“数额较大”（一般指50万元以上）的标准，但已经接近，且具体量刑还会考虑其他情节因素，如虚开的次数、手段、目的以及是否造成国家税款损失等。

1. 若情节相对较轻：

   • 如果您的虚开行为没有造成严重的国家税款损失，且没有其他严重情节，那么您可能面临三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金的处罚。但具体量刑还需由法院根据案件具体情况进行裁决。

2. 若存在加重情节：

   • 如果您的虚开行为存在其他严重情节，如曾因虚开受过刑事处罚或二次以上行政处罚又虚开、虚开手段恶劣、目的非法等，那么您可能面临更重的处罚，即三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。

三、追缴税款及从宽情节

• 无论您面临何种处罚，都需要对虚开的税款数额和实际骗取的国家税款数额承担刑事责任。法院在判决时，会要求您退缴虚开的税款，并可能根据您的悔罪表现、退赃情况等因素，考虑从轻、减轻或者免除处罚。

四、建议与措施

1. 立即停止虚开行为：

   • 如果您尚未被司法机关发现或查处，应立即停止虚开增值税专用发票的行为，避免进一步违法。

2. 咨询专业律师：

   • 鉴于此类案件的复杂性和严重性，建议您尽快咨询专业律师，了解您的法律权利和义务，以及可能面临的法律后果。律师可以为您提供准确的法律建议和指导，帮助您制定合适的应对策略。

3. 积极配合调查：

   • 如果您已经被司法机关调查或查处，应积极配合调查工作，如实供述自己的罪行，真诚悔罪，并尽可能退缴虚开的税款和非法所得。这有助于您在判决时获得从轻、减轻或者免除处罚的机会。

综上所述，虚开增值税专用发票40万的处理方式取决于具体情节和法律规定。无论您面临何种情况，都应严格遵守相关法律法规，避免涉及此类犯罪行为。若不慎涉入，应尽快咨询专业律师以获取准确的法律建议和指导。