就业协议中用人单位意见和用人单位上级主管部门意见是否必须填写，需分情况讨论：
一般情况：
- 用人单位意见：就业协议作为明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中权利和义务的书面表现形式，用人单位意见是核心部分，必须填写。这代表了用人单位对接收毕业生的明确意愿，是协议生效的关键要素之一。
- 用人单位上级主管部门意见：这一栏并非所有情况下都必须填写。它主要适用于那些需要上级主管部门审批或备案的用人单位，如国有企业、事业单位或某些特定行业的企业。对于这些单位，上级主管部门的意见是协议生效的必要条件之一，因为它涉及到单位内部的管理流程和审批程序。然而，对于大多数私营企业、外资企业或不需要上级主管部门审批的单位来说，这一栏可能并不适用，可以留空或注明“不适用”。
特殊情况：
- 如果就业协议中有明确规定或用人单位有特别要求，那么即使对于不需要上级主管部门审批的单位，也可能需要填写上级主管部门意见。这种情况下，毕业生应与用人单位沟通确认，并按照要求填写。
- 另外，如果毕业生对用人单位的上级主管部门情况不了解，或者不确定是否需要填写这一栏，最稳妥的做法是咨询用人单位的人力资源部门或相关负责人，以获取准确的信息和指导。
法律建议：
- 毕业生在签订就业协议前，应仔细阅读协议条款，了解各项内容的含义和要求。
- 对于不确定是否需要填写的部分，如用人单位上级主管部门意见，应及时与用人单位沟通确认，避免因遗漏或错误填写而导致协议无效或产生其他法律纠纷。
- 如果就业协议中有任何不明确或模糊的地方，毕业生有权要求用人单位进行解释和说明，以确保自己的权益得到充分保障。
可能后果：
- 如果未填写用人单位意见而直接签订就业协议，可能导致协议无效或无法履行，因为用人单位的明确意愿是协议生效的基础。
- 如果错误地填写了用人单位上级主管部门意见（如填写了不存在的部门或人员），也可能导致协议无效或产生其他法律纠纷。因此，在填写这一栏时，毕业生应确保信息的准确性和真实性。
总之，就业协议中用人单位意见是必须填写的，而用人单位上级主管部门意见则需根据具体情况来判断是否需要填写。毕业生在签订协议前应仔细阅读条款并咨询用人单位的意见，以确保协议的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。