结论：物业通过门禁卡收取物业费的行为是否合理，需分情况讨论。多数情况下，这种行为是不合理的，但特定情形下可能合理。以下是对此问题的详细分析：
一、不合理的情况及原因
门禁系统属于物业服务范畴：
- 根据《物业管理条例》，物业公司负责小区公共设施的维护与管理。门禁系统作为保障业主安全的基础设施之一，其日常维护（如设备检修、软件升级）应包含在物业费中。若物业公司以“门禁卡成本”为由额外收费，属于重复收费，是不合理的。
门禁卡成本极低：
- 普通IC门禁卡的采购成本通常仅为几元，且可重复使用。即使采用加密技术或特殊材质，单张成本也很少超过20元。若物业公司按每张30-50元甚至更高价格收取费用，显然超出了合理范围，是不合理的。
涉嫌强制消费：
- 部分物业公司要求业主必须购买指定门禁卡，否则无法进入小区或单元楼。这种行为限制了业主的选择权，可能违反《消费者权益保护法》中关于自主选择商品或服务的规定，因此也是不合理的。
二、可能合理的情形
首次办理免费，补办收费：
- 若物业公司明确规定：首次领取门禁卡免费，但因业主个人原因丢失或损坏后补办需支付工本费（建议不超过10-20元），这种做法较为合理。因为补办门禁卡确实会产生一定的成本，如卡片成本、信息写入费用等。
高端定制服务：
- 对于采用生物识别（指纹、人脸）、蓝牙等技术的智能门禁系统，若物业公司提前公示收费标准并说明理由（如设备成本高、需定期更新数据库），且费用透明（例如押金可退、工本费合理），则可能被接受。因为这种高端定制服务超出了普通门禁系统的服务范围，业主可以根据自身需求选择是否接受。
合同约定明确：
- 若前期物业服务合同或业主公约中已明确约定门禁卡收费标准，且经过业主大会表决通过，则按合同执行具有合法性。但需确保程序合规，避免物业公司单方面制定霸王条款。
三、法律依据与建议
法律依据：
- 《物业管理条例》第四十四条：物业服务企业不得向业主收取未约定的费用。
- 《消费者权益保护法》第九条：消费者享有自主选择商品或者服务的权利。
- 《民法典》第九百四十三条：物业服务人应当定期将服务的事项、负责人员、质量要求、收费项目、收费标准、履行情况，以及维修资金使用情况、业主共有部分的经营与收益情况等以合理方式向业主公开并向业主大会、业主委员会报告。
业主应对策略：
- 核查合同：检查前期物业服务协议是否包含门禁卡收费条款。
- 集体协商：通过业主委员会与物业公司沟通，要求降低费用或纳入物业费。
- 投诉举报：向当地住建局、物价局或消协反映问题，必要时提起诉讼。
- 证据留存：保存收费凭证、沟通记录等材料，便于维权。
四、特殊情况说明
- 若业主未交物业费，物业无权因此拒绝发放或停用门禁卡。因为门禁卡是业主进出小区的基本凭证，关乎业主对小区共有部分的正常使用和通行权利。物业应通过合法、合理的途径来催缴物业费，如协商沟通、书面催缴通知等。
总结：物业通过门禁卡收取物业费的行为是否合理，需结合具体情况判断。在多数情况下，这种行为是不合理的，尤其是高额收费或强制购买行为。业主应积极核查合同、集体协商、投诉举报并留存证据，以维护自身合法权益。若遇到特殊情况或复杂问题，可直接向我咨询，我将为你提供专业的法律建议。