结论：一般情况下，您不能因承租人拖欠租金而扣押存放于厂房内的属于第三方所有的货物。以下从多个角度为您详细分析：

法律关系角度

1. 租赁合同关系：您与承租人之间存在租赁合同关系，根据租赁合同的约定，承租人有义务按时支付租金。当承租人拖欠租金时，您有权依据租赁合同向承租人主张权利，例如要求承租人支付拖欠的租金、违约金等，甚至在符合合同约定和法律规定的情况下解除租赁合同。
2. 货物所有权关系：存放于厂房内的货物属于第三方所有，您与第三方之间并不存在直接的合同关系。根据物权法的原则，物权的所有权人对其所有的物享有占有、使用、收益和处分的权利。因此，第三方对其货物享有完整的所有权，您无权擅自扣押第三方的货物。

法律后果角度

1. 对第三方的侵权责任：如果您擅自扣押第三方的货物，可能构成对第三方物权的侵犯。第三方有权要求您返还货物，并可能要求您承担因扣押货物而给其造成的损失，如货物的贬值损失、运输费用、仓储费用等。在极端情况下，如果您的扣押行为给第三方造成了严重的经济损失或商业信誉损害，第三方还可能要求您承担惩罚性赔偿责任。
2. 对您与承租人租赁合同关系的影响：虽然您扣押货物的目的是为了促使承租人支付租金，但这种行为可能违反法律规定，导致您在与承租人的租赁合同纠纷中处于不利地位。承租人可能以此为由主张您违约，要求您承担违约责任，如赔偿因扣押货物而给其造成的损失等。此外，如果您的扣押行为被认定为非法，还可能影响您通过法律途径追讨租金的效率和效果。

合法解决途径

1. 与承租人协商：您可以首先尝试与承租人进行协商，了解其拖欠租金的原因，并寻求双方都能接受的解决方案。例如，您可以与承租人协商延长租金支付期限、分期支付租金等。
2. 发送催告函：如果协商无果，您可以向承租人发送催告函，明确要求其在一定期限内支付拖欠的租金，并告知其如果逾期不支付将承担的法律后果。催告函可以起到提醒和警示的作用，有时能够促使承租人主动履行支付租金的义务。
3. 提起诉讼或申请仲裁：如果承租人仍然拒绝支付租金，您可以根据租赁合同的约定向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，您可以要求承租人支付拖欠的租金、违约金以及因追讨租金而产生的合理费用（如律师费、诉讼费等）。如果法院或仲裁机构判决或裁决承租人支付租金，但承租人仍然不履行义务，您可以申请强制执行。

建议：在处理此类问题时，建议您保持冷静和理性，避免采取过激或违法的行为。如果您对具体的法律程序或操作有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况为您提供详细的法律建议和指导。