结论：协会会长和理事长是否可以来自同一个公司，这主要取决于协会的章程以及相关法律法规的规定，一般情况下，若章程和法律无明确禁止，则可能允许；但若存在利益冲突或特定限制，则可能不允许。以下从不同角度进行详细分析：

一、协会章程的规定

1. 章程的自主性：协会章程是协会的基本法律文件，它规定了协会的组织结构、管理方式、会员权利与义务等核心内容。因此，协会会长和理事长的任职资格，首先应遵循协会章程的规定。

2. 章程的具体内容：如果协会章程明确规定了会长和理事长不能来自同一个公司，那么这一规定就必须得到遵守。反之，如果章程没有这样的限制，或者允许在特定条件下由同一公司的人员担任，那么从章程的角度来看，就是可行的。

二、相关法律法规的考量

1. 法律法规的普遍性：除了协会章程外，还需要考虑相关法律法规对协会会长和理事长任职资格的规定。这些法律法规可能包括社团管理条例、公司法等相关法律文件。

2. 利益冲突与回避原则：在法律法规中，通常会强调利益冲突与回避原则。如果协会会长和理事长来自同一个公司，可能会引发利益冲突的问题，比如决策偏袒、资源分配不均等。因此，在存在潜在利益冲突的情况下，法律法规可能会限制或禁止同一公司的人员同时担任这两个职务。

3. 特定行业的限制：对于某些特定行业的协会，法律法规可能会有更严格的限制。比如，在金融、医疗等敏感行业，为了保障行业的公正性和透明度，可能会规定协会的高级管理人员不能来自同一公司或存在其他利益关联。

三、实际操作中的建议

1. 审查协会章程：在决定是否由同一公司的人员担任协会会长和理事长之前，应首先审查协会章程，了解其中关于这两个职务任职资格的具体规定。

2. 咨询相关部门：如果章程中没有明确规定，或者存在模糊之处，建议咨询相关的社团管理部门或法律顾问，以获取更准确的法律意见。

3. 考虑利益冲突：即使章程和法律没有明确禁止，也应充分考虑可能存在的利益冲突问题，并采取相应的措施进行防范和化解。比如，可以建立严格的决策机制、信息披露制度等，以确保协会的公正性和透明度。

总结与建议：协会会长和理事长是否可以来自同一个公司，并没有一个绝对的答案。它取决于协会的章程、相关法律法规的规定以及实际操作中的利益冲突考量。因此，在做出决策之前，应充分审查章程、咨询法律意见，并考虑可能存在的利益冲突问题。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。