结论：行业协会会长和秘书长由同一大股东投资的不同法人单位的人员担任，在法律上并没有直接的禁止性规定，但具体是否可行还需结合行业协会的章程、相关法律法规以及实际运作情况来综合判断。
一、法律层面分析
法人独立性原则：
- 不同法人单位，即使由同一大股东投资，它们在法律上仍然是独立的主体，享有独立的法人财产权，承担独立的民事责任。因此，从法人独立性的角度来看，同一大股东投资的不同法人单位的人员担任行业协会的会长和秘书长，并不直接违反法律原则。
行业协会章程规定：
- 行业协会的章程是其组织活动的根本准则，通常会规定会长、秘书长的任职资格、选举方式等。如果章程中没有明确禁止同一大股东投资的不同法人单位的人员担任这些职务，那么从章程的角度来看，这种安排是可行的。
反垄断与公平竞争：
- 虽然法律没有直接禁止这种安排，但如果这种安排导致行业协会在运作过程中出现不公平竞争、垄断行为等，就可能触犯反垄断法等相关法律法规。因此，在实际操作中，需要确保这种安排不会损害行业协会的公平性和公正性。
二、实际操作层面分析
利益冲突与回避：
- 即使法律上没有禁止，但同一大股东投资的不同法人单位的人员担任行业协会的会长和秘书长，可能会引发利益冲突的问题。为了避免这种情况，可以建立利益冲突回避机制，确保在决策过程中能够公正无私。
公众认知与接受度：
- 这种安排可能会引发公众对行业协会公正性的质疑。因此，在实际操作中，需要充分考虑公众认知和接受度，通过公开透明的方式运作行业协会，增强公众信任。
行业协会的运作效率：
- 同一大股东投资的不同法人单位的人员担任会长和秘书长，可能会在一定程度上影响行业协会的运作效率。为了避免这种情况，可以明确各自的职责和权限，建立有效的沟通机制，确保行业协会能够高效运作。
三、建议与注意事项
审查行业协会章程：
- 在决定由同一大股东投资的不同法人单位的人员担任会长和秘书长之前，应仔细审查行业协会的章程，确保这种安排符合章程规定。
建立利益冲突回避机制：
- 为了避免利益冲突，可以建立相应的回避机制，如规定在涉及特定利益事项时，相关人员应回避决策过程。
增强透明度与公众参与：
- 通过公开透明的方式运作行业协会，增强公众对行业协会的信任和支持。可以定期公布行业协会的财务状况、决策过程等信息，接受公众监督。
咨询专业法律意见：
- 在做出最终决定之前，建议咨询专业法律意见，确保这种安排在法律上没有问题，并能够为行业协会的长期发展奠定良好基础。
如果您在婚姻家庭、经济纠纷领域有任何法律问题，欢迎直接向我咨询。