在合同纠纷中，提出异议后的裁决通常由仲裁机构或法院来决定，具体取决于纠纷解决的方式和相关的法律规定。以下从不同角度进行详细分析：
仲裁机构裁决：
- 适用情形：如果合同双方在合同中约定了仲裁条款，或者事后达成了仲裁协议，那么当一方提出异议时，通常会将争议提交给约定的仲裁机构进行裁决。
- 法律依据：根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，仲裁机构有权根据双方提交的证据和法律规定，对争议事项进行裁决。
- 裁决效力：仲裁裁决具有终局性，对双方当事人均有约束力。除非存在法定撤销情形，否则一方必须履行裁决结果。
法院裁决：
- 适用情形：如果合同中没有约定仲裁条款，或者事后没有达成仲裁协议，那么一方提出异议时，可以向有管辖权的法院提起诉讼。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院有权根据双方提交的证据和法律规定，对争议事项进行审理并作出判决。
- 判决效力：法院判决同样具有终局性，对双方当事人均有约束力。一方不履行判决结果的，另一方可以申请法院强制执行。
特殊情形下的裁决：
- 调解或和解：在仲裁或诉讼过程中，双方也可以选择通过调解或和解的方式解决争议。如果达成调解或和解协议，那么该协议将作为裁决或判决的依据。
- 专家鉴定或评估：在某些复杂的合同纠纷中，可能需要专家对特定问题进行鉴定或评估。专家的意见或报告可能作为裁决或判决的参考依据。
法律建议：
- 在签订合同时，建议明确约定争议解决方式（仲裁或诉讼），以避免未来可能出现的纠纷。
- 如果发生争议，建议及时收集并保存相关证据，以便在仲裁或诉讼过程中支持自己的主张。
- 在提出异议前，建议先咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
可能后果：
- 如果一方不履行仲裁裁决或法院判决，另一方可以申请强制执行，这可能导致被执行人的财产被查封、扣押或拍卖等后果。
- 如果一方在仲裁或诉讼过程中提供虚假证据或隐瞒重要事实，可能面临法律责任，包括罚款、拘留甚至刑事责任。
如有任何合同纠纷方面的法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。