结论前置：出租人同意承租人在租赁耕地上建房后，能否起诉收回需分情况讨论，主要取决于租赁合同约定、建房行为合法性及双方协商情况。以下从不同角度展开分析：

1. 若租赁合同明确约定建房及收回条件

• 合同效力优先：若双方在租赁合同中明确约定“承租人经出租人同意可在耕地上建房，但租赁期满或特定条件下（如承租人违约、政府征用等）房屋归出租人所有，且出租人有权收回土地”，则出租人可依据合同约定起诉收回土地及房屋（或要求承租人拆除房屋、恢复土地原状）。
• 法律依据：根据《民法典》第七百零三条，租赁合同是出租人将租赁物交付承租人使用、收益，承租人支付租金的合同。若合同条款不违反法律强制性规定（如耕地保护政策），则对双方具有约束力。

2. 若建房行为违反法律强制性规定（如耕地保护政策）

• 合同可能部分无效：根据《土地管理法》第三十七条，禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼，且非农业建设必须依法申请使用国有土地。若承租人在耕地上建房未履行合法审批手续（如未办理农用地转用审批、乡村建设规划许可证等），则建房行为可能因违反法律强制性规定而无效。
• 出租人权利受限：即使出租人同意建房，若房屋因违法建设被行政机关责令拆除或没收，出租人可能无法通过诉讼主张“收回房屋”（因房屋本身不合法），但可依据合同约定或《民法典》第五百七十七条要求承租人承担违约责任（如赔偿损失、恢复土地原状等）。

3. 若双方未明确约定收回条件，但建房导致土地性质改变

• 出租人可主张解除合同：若承租人建房导致耕地无法恢复原状（如硬化地面、永久性建筑等），出租人可依据《民法典》第七百一十一条（承租人未按照约定的方法或未根据租赁物的性质使用租赁物，致使租赁物受到损失的，出租人可以解除合同并请求赔偿损失）起诉解除合同，并要求承租人拆除房屋、恢复土地或赔偿损失。
• 行政干预风险：若建房行为涉嫌违法用地，行政机关可能直接介入处理（如责令拆除、罚款等），此时出租人需配合行政程序，并可依据合同约定或法律规定向承租人追责。

4. 若双方协商一致提前收回

• 协商优先：若出租人与承租人协商一致提前终止租赁关系，并就房屋处理（如拆除、折价补偿等）达成协议，则出租人无需通过诉讼收回，可直接依据协议执行。
• 书面协议重要性：建议双方签订书面协议，明确收回时间、房屋处理方式及违约责任，避免后续纠纷。

实务建议

1. 审查合同条款：出租人应首先检查租赁合同是否明确约定建房及收回条件，避免因条款模糊导致维权困难。
2. 核实建房合法性：若承租人已建房，出租人需确认建房是否履行合法审批手续（如向自然资源部门查询），避免因违法建设导致合同无效或行政处罚。
3. 协商与诉讼结合：若双方争议较大，建议先通过协商解决（如承租人补偿出租人损失后拆除房屋）；若协商无果，再通过诉讼主张权利。

总结：出租人能否起诉收回土地及房屋，需结合合同约定、建房合法性及双方协商情况综合判断。若您面临此类纠纷，可直接向我咨询具体细节，我将根据实际情况为您提供法律方案。