仲裁协议是当事人申请仲裁排除法院管辖的依据，这句话的意思是，当双方当事人达成有效的仲裁协议后，就排除了法院对协议中约定争议事项的司法管辖权，当事人应当通过仲裁方式解决争议，而不能向法院提起诉讼。以下从多个角度为你详细解释：

法律依据

1. 《中华人民共和国仲裁法》第五条：明确规定当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。这一条款直接确立了仲裁协议对诉讼管辖权的排除效力，是仲裁协议能够排除法院管辖的最直接法律依据。
2. 《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定：虽然民事诉讼法主要规定的是诉讼程序，但也间接体现了仲裁协议对诉讼管辖权的排除。例如，在涉外经济贸易、运输和海事中发生的纠纷，当事人在合同中订有仲裁条款或者事后达成书面仲裁协议，提交中华人民共和国涉外仲裁机构或者其他仲裁机构仲裁的，当事人不得向人民法院起诉。

仲裁协议排除法院管辖的具体体现

1. 起诉阶段：如果当事人在合同中约定了仲裁条款或事后达成了仲裁协议，当纠纷发生时，一方当事人向法院起诉，法院经审查发现存在有效仲裁协议的，会裁定不予受理。例如，甲乙两公司在买卖合同中约定“因本合同引起的或与本合同有关的任何争议，双方应首先通过友好协商解决；协商不成的，任何一方均有权将争议提交中国国际经济贸易仲裁委员会按照其仲裁规则进行仲裁”。后来双方因货物质量问题产生纠纷，甲公司向法院起诉，法院审查后认为存在有效仲裁协议，遂裁定不予受理。
2. 审理阶段：若法院在立案后发现存在有效仲裁协议，且另一方当事人在首次开庭前提出异议的，法院应当驳回起诉。继续以上述案例为例，假设法院未及时发现仲裁协议而立案，在审理过程中乙公司提出存在仲裁协议，要求法院驳回甲公司的起诉，法院经审查属实后，会依法驳回甲公司的起诉。
3. 执行阶段：对于仲裁机构作出的裁决，当事人可以向有管辖权的人民法院申请执行。但如果一方当事人就同一纠纷向人民法院起诉的，人民法院不予受理。这意味着在仲裁裁决作出后，当事人不能再就同一事项向法院寻求司法救济，只能通过执行程序来实现自己的权益。

仲裁协议排除法院管辖的条件

要使仲裁协议具备法律效力并排除法院的管辖权，必须满足以下条件：

1. 请求仲裁的意思表示明确：双方当事人必须在仲裁协议中清晰地表达出愿意通过仲裁方式解决纠纷的意愿，任何模糊不清或存在歧义的表述都可能影响仲裁协议的效力。
2. 仲裁事项具体可仲裁：仲裁协议应明确约定将哪些具体的争议事项提交仲裁，如合同纠纷中的货物质量、价款支付等。同时，这些仲裁事项必须具有可仲裁性，即不违反法律的强制性规定和社会公共利益。
3. 选定的仲裁委员会确定：双方当事人在仲裁协议中必须明确指定一个具体的仲裁机构来受理案件。如果未指定或指定的仲裁机构不明确，将导致仲裁协议无效。

仲裁协议排除法院管辖的例外情况

虽然仲裁协议原则上排除法院管辖权，但也存在一些例外情形：

1. 仲裁协议无效：如果仲裁协议存在法定无效情形，如约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围、无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议等，则仲裁协议无效，此时法院可以行使管辖权。
2. 仲裁机构无法履行职责：在某些特殊情况下，如仲裁机构不存在、仲裁庭组成不符合规定等，导致仲裁程序无法进行，当事人可以向法院提起诉讼，由法院对争议进行审理。
3. 一方当事人请求确认仲裁协议效力：当事人对仲裁协议的效力有异议的，可以请求仲裁委员会作出决定或者请求人民法院作出裁定。在这种情况下，法院有权对仲裁协议的效力进行审查，但这并不意味着法院直接取得了对实体争议的管辖权，只是在确定仲裁协议效力的基础上，再决定是否由仲裁机构继续处理争议。

总结与建议：

仲裁协议作为当事人申请仲裁排除法院管辖的依据，其法律效力是明确且具体的。在签订仲裁协议时，双方当事人应确保协议的合法性、有效性和明确性，以避免可能出现的纠纷和争议。如果遇到仲裁协议效力或仲裁与诉讼管辖权相关的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。