针对您提出的“违法占地农田超过一亩怎么处理”的问题，以下是我根据相关法律法规为您提供的详细解答：
一、违法占地农田超过一亩的处罚依据
违法占地农田的行为，主要依据《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国土地管理法实施条例》以及各地方可能制定的相关法规进行处罚。这些法律法规旨在保护土地资源，维护土地管理秩序，对违法占地行为有明确的处罚规定。
二、常见处罚方式
责令退还非法占用的土地：
- 违法者必须将非法占用的农田退还给原土地所有者或使用者，以恢复土地的合法使用状态。这是最基本的处罚方式，也是保护土地资源的重要措施。
没收违法所得及新建的建筑物和其他设施：
- 如果违法者在非法占用的农田上进行了经营活动并获得了收益，这些收益将被没收。
- 当违法占用农田符合土地利用总体规划时，相关部门会没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施。
罚款：
- 根据非法占地面积、土地类型（如耕地、林地等）、违法情节等因素，对违法者处以一定数额的罚款。具体罚款标准由法律规定或地方政府制定，一般为非法占用土地每平方米100元以上1000元以下。因此，违法占地一亩（约666.67平方米）的罚款大致在66667元至666670元之间。
限期拆除新建的建筑物和其他设施：
- 如果违法占用的农田是农用地且违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，相关部门会要求限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，以恢复土地原状。
恢复土地原状：
- 非法占地行为对农田造成破坏的，违法者需承担恢复土地原状的责任，确保农田能够恢复到被占用前的状态，包括土壤质量、灌溉设施等。
刑事责任：
- 如果非法占用耕地“数量较大”且造成耕地大量毁坏的，可能会触犯《中华人民共和国刑法》，构成非法占用农用地罪。虽然违法占地一亩通常不构成此罪，但如果存在严重破坏种植条件等特殊情况，也可能面临刑事责任的追究。
三、注意事项与建议
地区差异：
- 具体处罚方式可能因地区差异而有所不同。不同地方可能根据当地实际情况制定更具体的处罚标准或措施。因此，建议咨询当地自然资源主管部门或专业律师以获取最准确的信息和建议。
合法合规使用土地：
- 违法占地行为不仅涉及法律责任，还可能对土地资源和生态环境造成不可逆的损害。因此，个人和企业应严格遵守相关法律法规，不得进行任何形式的非法占地行为。
咨询与求助：
- 如面临土地使用问题或不确定自己的行为是否合法，应及时咨询当地自然资源部门或专业律师。他们可以提供专业的法律意见和帮助，确保您的行为合法合规。
综上所述，违法占地农田超过一亩将面临严重的法律处罚和不良后果。为了保护土地资源、维护土地管理秩序以及避免不必要的法律风险，请务必严格遵守相关法律法规，合法合规使用土地。