在涉企案件中，若同一案件涉及两个罪名（两罪同案），需根据具体案情，结合刑法规定、司法解释及刑事诉讼程序进行综合处理。具体处理方式如下：

1. 罪名认定与区分
   首先需明确两罪的构成要件，区分行为是否独立符合不同罪名的犯罪构成。例如，企业负责人同时涉及职务侵占罪（利用职务便利非法占有公司财物）和挪用资金罪（挪用资金归个人使用或借贷给他人），若两行为独立且分别满足两罪要件，则可能数罪并罚；若行为存在牵连或吸收关系（如挪用后未归还转化为侵占），则可能按重罪处罚或择一认定。

2. 数罪并罚的适用条件
   根据《刑法》第六十九条，若行为人实施两个以上独立犯罪行为，且均构成犯罪，应数罪并罚。例如，企业通过虚开发票罪（虚开增值税专用发票）和逃税罪（通过虚开发票逃避缴纳税款）实施犯罪，若两行为无牵连关系，则需对两罪分别定罪量刑后合并执行刑罚。

3. 竞合与牵连关系的处理
   若两罪存在竞合（如一个行为同时触犯两罪）或牵连关系（如手段行为与目的行为分别构成不同罪名），需根据《刑法》理论及司法实践选择适用原则：

   • 想象竞合：从一重罪处罚（如企业通过伪造公文实施诈骗，同时触犯伪造国家机关公文罪和诈骗罪，按诈骗罪处罚）；
     
   • 牵连犯：通常从一重罪处罚，但法律有特别规定的除外（如非法经营罪与诈骗罪竞合时，可能按诈骗罪处罚）。

4. 量刑情节的考量
   在两罪同案中，需综合评估自首、立功、退赃退赔、认罪认罚等量刑情节。例如，企业或个人在涉税案件中同时构成逃税罪和虚开发票罪，若主动补缴税款并配合调查，可能从轻或减轻处罚；若存在累犯、主犯等从重情节，则需依法加重处罚。

5. 程序上的合并审理
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，同一被告人涉及两罪同案的，法院应合并审理；若涉及多个被告人或单位犯罪，需根据共同犯罪理论划分主从犯责任。例如，企业与直接责任人员同时构成污染环境罪和非法经营罪的，需分别追究单位和个人的刑事责任，并在量刑时考虑单位犯罪的特殊性。

建议：涉企两罪同案的处理需结合具体罪名、行为关系及量刑情节综合判断。若企业或个人面临此类问题，可直接向我咨询，我将结合案情提供详细法律分析。