若施工单位整改后依然不符合要求，可采取以下措施进行处理：

1. 再次发出整改通知并明确期限：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》及相关建设工程施工合同条款，发包方有权要求承包方按照合同约定及国家相关工程质量标准进行施工。若初次整改未达标，发包方应再次向施工单位发出书面整改通知，明确指出未达标部分，并设定合理的再次整改期限。
   • 操作建议：整改通知应详细、具体，包括但不限于未达标的具体项目、整改要求、整改期限及逾期未整改的后果等，确保施工单位清晰了解整改要求。

2. 委托第三方检测或鉴定：

   • 法律依据：在施工单位整改后，若发包方对整改结果仍有疑虑，可依据合同约定或相关法律规定，委托具有相应资质的第三方机构对工程质量进行检测或鉴定。
   • 操作建议：选择第三方机构时，应确保其具有合法资质和良好信誉，检测或鉴定过程应公开、透明，结果应客观、公正。若检测或鉴定结果显示工程质量仍不符合要求，可作为后续处理的依据。

3. 依据合同约定追究违约责任：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于合同违约责任的规定，若施工单位未按合同约定履行整改义务，或整改后仍不符合要求，发包方有权要求施工单位承担违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿损失等。
   • 操作建议：在追究违约责任前，应仔细审查合同条款，明确违约责任的承担方式和计算方法。同时，收集并保存好相关证据，如整改通知、检测报告、沟通记录等，以支持自己的主张。

4. 考虑解除合同或寻求法律救济：

   • 法律依据：若施工单位多次整改仍不符合要求，且严重影响工程进度或质量，发包方有权依据合同约定或相关法律规定解除合同，并要求施工单位承担因此造成的损失。同时，发包方也可向人民法院提起诉讼或申请仲裁，寻求法律救济。
   • 操作建议：在决定解除合同或寻求法律救济前，应充分评估解除合同或诉讼/仲裁的成本与收益，以及可能带来的风险。同时，咨询专业律师的意见，制定合适的策略。

5. 加强后续监管与验收：

   • 预防措施：为避免类似情况再次发生，发包方应加强对施工单位的后续监管，定期或不定期对工程质量进行检查。同时，在工程竣工验收时，应严格按照国家相关标准和合同约定进行验收，确保工程质量符合要求。
   • 操作建议：建立完善的监管和验收机制，明确监管和验收的责任主体、流程和标准。加强与施工单位的沟通与协调，及时解决施工过程中出现的问题。

在处理此类问题时，建议发包方保持冷静、理性，依据合同约定和法律规定采取合理、合法的措施，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可直接向我咨询。