二次非法营运的处罚通常包括罚款、没收违法所得，情节严重的还可能面临拘留或追究刑事责任，具体处罚需结合实际情况判定。以下是详细分析：

1. 行政处罚层面：

   • 根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条，未取得道路运输经营许可擅自从事道路运输经营的，由县级以上地方人民政府交通运输主管部门责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款。
   • 二次非法营运属于“情节严重”的范畴，处罚力度会显著加重。例如，罚款金额可能接近法定上限，若首次违法时已适用较低档罚款（如3万元），二次违法时可能直接按10万元处罚。
   • 若存在其他加重情节（如暴力抗法、造成交通事故等），还可能面临暂扣或吊销驾驶证、强制报废车辆等附加处罚。

2. 刑事责任层面：

   • 若二次非法营运行为构成《刑法》第二百二十五条规定的非法经营罪（如经营数额巨大、造成严重后果等），将面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
   • 例如，若二次非法营运涉及跨省运输、长期规模化经营，或因非法营运导致重大交通事故，均可能触发刑事追责。

3. 特殊情形说明：

   • “二次”的认定：以行政处罚记录或刑事判决记录为准，若首次违法未被查处，但后续被查实时发现存在多次违法行为，仍可能按“二次”或“多次”从重处罚。
   • 地区差异：部分地方性法规可能对非法营运设定更严格的处罚标准（如提高罚款基数、增加拘留条款），需结合当地规定具体分析。

建议：若您或他人涉及二次非法营运被查处，需尽快委托律师介入，通过陈述从轻情节（如家庭困难、初犯误判等）、争取行政复议或刑事辩护，以最大限度减少损失。如有进一步细节需要分析，可直接向我咨询。