在还款后对方不归还借条的情况下，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

一、保留还款证据

这是最为关键的一步，因为还款证据是证明你已经履行还款义务的基础。具体来说：

1. 转账记录：如果借款是通过银行转账或第三方支付平台（如微信、支付宝）进行的，务必妥善保存转账凭证，包括转账时间、金额、收款人信息等。这些记录是证明还款事实的重要证据。
2. 收据或收条：如果还款时有第三方在场，可以请其作为见证人并出具收据或收条；若通过现金方式还款且对方未提供收据，可尝试要求对方补写，或通过录音、录像等方式固定还款过程及双方关于债务消灭的确认。
3. 聊天记录：如果双方在还款前后有相关的沟通记录，如短信、微信、邮件等，也应一并保存。这些记录可能包含对方承认还款或表示债务已结清的内容。

二、与对方协商

在保留好还款证据的基础上，你可以尝试与对方进行沟通，说明情况并要求其归还借条或出具书面证明，表明债务已经清偿。如果对方同意，最好签订一份书面的债务结清协议，以避免未来可能出现的纠纷。在沟通过程中，建议保留聊天记录或通话录音作为备份，以防对方反悔。

三、采取法律措施

如果对方拒绝归还借条或出具书面证明，且双方无法达成和解，你可以考虑采取以下法律措施：

1. 申请支付令：虽然在此场景下你已经还款，但你可以通过申请支付令的程序来确认债务消灭状态。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，债权人可以向人民法院申请支付令，要求债务人履行还款义务（在此为确认债务已消灭）。若债务人未在法定期限内提出异议，支付令即具有强制执行力。不过，这一步骤更多适用于对方未还款的情况，但在此作为确认债务消灭的一种手段，也可以考虑尝试。
2. 提起诉讼：你可以向人民法院提起诉讼，要求确认债务已经清偿。在诉讼过程中，你需要提供充分的证据证明还款事实的存在，如上述提到的转账记录、收据或收条、聊天记录等。法院将根据双方提供的证据和法律规定进行审理和判决。如果法院确认债务已经清偿，那么对方持有的借条就失去了法律效力。

四、预防措施与注意事项

1. 及时行动：发现借条遗失或对方拒绝归还后，应尽快采取措施收集证据并与对方沟通，避免拖延导致证据丢失或诉讼时效过期。
2. 合法合规：在收集证据和维权过程中，必须遵守法律法规，不得采用非法手段获取证据或侵犯他人权益。
3. 加强预防：为避免类似情况再次发生，建议在未来的借款交易中更加谨慎。签订详细的借款合同，明确约定还款方式、时间及借条归还等事项，并确保自己保留了充分的证据。

总结与建议：面对还款后对方不归还借条的情况，保持冷静并采取上述综合措施至关重要。通过全面收集证据、积极沟通协商、采取法律措施及加强预防措施，你可以有效保护自己的合法权益。如果在这个过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律建议。