结论前置：小区物业管理费银行代扣手续费由业主自行承担是否合理，需分情况讨论，主要取决于物业服务合同中的约定以及相关法律法规的规定。
合同约定优先：
- 情况说明：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人的权利义务由合同约定。如果物业服务合同中明确约定了物业管理费银行代扣手续费由业主承担，那么这一约定是合法有效的，业主应当按照合同约定履行。
- 法律建议：业主在签订物业服务合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于费用承担的部分，确保自己了解并同意合同中的所有约定。如果合同中有此类约定，且业主已经签字确认，那么业主就需要承担相应的手续费。
合同未约定或约定不明：
- 情况说明：如果物业服务合同中没有明确约定物业管理费银行代扣手续费由谁承担，或者约定不明确，那么根据公平原则和交易习惯，这一费用通常应由提供服务的一方（即物业公司）承担。因为手续费是物业公司为了方便收取物业管理费而选择银行代扣方式所产生的额外费用，理应由物业公司自行承担。
- 法律建议：在这种情况下，业主可以与物业公司进行协商，要求物业公司承担手续费。如果协商不成，业主可以向当地的房地产管理部门或者消费者协会投诉，寻求帮助解决纠纷。
法律法规的特别规定：
- 情况说明：虽然目前没有直接的法律法规明确规定物业管理费银行代扣手续费由谁承担，但相关法律法规对于物业服务费用的收取、使用和管理都有明确的规定。如果物业公司违反了这些规定，比如擅自提高手续费标准或者将手续费转嫁给业主，那么业主有权拒绝支付，并向相关部门投诉。
- 法律建议：业主在遇到此类情况时，应首先了解当地的物业服务费用管理规定，确保自己的权益不受侵害。如果发现物业公司有违规行为，应及时向相关部门举报，维护自己的合法权益。
进一步思考：为了避免类似的纠纷发生，业主在签订物业服务合同时，应尽可能要求物业公司明确各项费用的承担方式和标准，并在合同中详细列明。同时，业主也应增强自己的法律意识，了解自己的权利和义务，以便在遇到纠纷时能够及时有效地维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。