在确认劳动关系的劳动仲裁中，用人单位通常承担主要的举证责任。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、用人单位举证责任的一般原则
在劳动争议案件中，根据“谁主张，谁举证”的一般原则，劳动者和用人单位都应当对自己的主张提供证据。然而，在确认劳动关系的案件中，由于劳动者往往处于相对弱势的地位，且用人单位掌握着更多的管理资料和证据，因此，用人单位通常需要承担更多的举证责任。这主要体现在用人单位需要提供与劳动者签订的劳动合同、工资支付记录、考勤记录等证据来证明双方之间是否存在劳动关系。
二、用人单位具体举证责任的内容
劳动合同：用人单位应当提供与劳动者签订的书面劳动合同，这是证明劳动关系存在的最直接证据。如果用人单位未与劳动者签订书面劳动合同，但存在事实劳动关系，用人单位仍需提供其他证据来证明。
工资支付记录：用人单位应当提供劳动者的工资支付记录，包括工资条、银行转账记录等，以证明用人单位向劳动者支付了劳动报酬。
考勤记录：用人单位应当提供劳动者的考勤记录，如打卡记录、签到表等，以证明劳动者在用人单位的工作时间和出勤情况。
其他证据：除了上述证据外，用人单位还可以提供其他与劳动关系相关的证据，如工作证、服务证、招聘广告、同事证言等。
三、用人单位未履行举证责任的后果
如果用人单位未能提供充分的证据来证明与劳动者之间不存在劳动关系，或者提供的证据存在瑕疵或矛盾，劳动仲裁机构或法院可能会倾向于认定双方之间存在劳动关系。这是因为，在劳动关系确认案件中，用人单位作为管理者和证据掌握者，有义务提供充分的证据来支持其主张。如果用人单位未能履行这一义务，应当承担不利的法律后果。
四、劳动者的举证责任
虽然用人单位在确认劳动关系的案件中承担主要的举证责任，但劳动者也需要提供一定的证据来支持其主张。例如，劳动者可以提供工作证、服务证、工作服、工资条等证据来证明其与用人单位之间存在劳动关系。如果劳动者无法提供这些证据，但能够提供其他间接证据或线索，如同事证言、工作记录等，也有助于证明劳动关系的存在。
五、特殊情况下的举证责任分配
在某些特殊情况下，如劳动者主张加班费、未休年休假工资等，举证责任可能会发生转移或部分转移。例如，在加班费争议中，如果用人单位主张已经支付了加班费，但无法提供充分的证据来证明，而劳动者能够提供初步证据证明存在加班事实，举证责任可能会部分转移给用人单位，要求用人单位提供反证来证明其主张。
总结与建议：
在确认劳动关系的劳动仲裁中，用人单位通常承担主要的举证责任。为了维护自己的合法权益，用人单位应当妥善保管与劳动关系相关的证据，并在劳动争议发生时及时提供。同时，劳动者也应当积极收集证据来支持自己的主张。如果你在劳动仲裁中遇到确认劳动关系的问题，或者对用人单位的举证责任有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。