将合同章、法人章、公司公章放在一起管理，确实存在多方面的风险，具体分析如下：

1. 表见代理与越权使用风险：

   • 风险描述：若印章由同一人或同一部门保管，可能因管理不善导致印章被非授权人员使用，进而引发表见代理问题。例如，非授权人员使用公章签订合同，相对方可能基于善意信赖合同的有效性，而公司则需承担合同责任。
   • 法律依据：根据《九民纪要》第41条，人民法院在审理案件时，主要审查签约人于盖章之时有无代表权或代理权。若因印章管理不善导致非授权人员使用印章，公司可能面临承担合同责任的风险。
   • 建议措施：建立严格的印章使用登记制度，明确印章使用权限和审批流程，确保每次使用都有记录可查。同时，公章、合同章、法人章应分人保管，避免权力集中。

2. 印章遗失或被盗用风险：

   • 风险描述：若印章集中保管且安全措施不足，一旦遗失或被盗用，可能被不法分子用于非法活动，如签订虚假合同、伪造文件等，给公司带来巨大损失。
   • 法律依据：印章遗失或被盗用后，若未及时挂失或报案，公司可能需对由此产生的法律后果承担责任。此外，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，伪造公司印章还可能构成犯罪。
   • 建议措施：加强印章保管场所的安全措施，如安装监控摄像头、使用保险柜等。一旦发现印章遗失或被盗用，应立即登报声明作废，并向公安机关报案。

3. 内部管理混乱与效率低下风险：

   • 风险描述：印章集中管理可能导致内部管理混乱，如印章使用审批流程繁琐、使用记录不清晰等，进而影响公司运营效率。
   • 建议措施：优化印章管理流程，明确各部门在印章使用中的职责和权限。同时，利用现代信息技术手段，如电子印章管理系统，提高印章使用的透明度和可追溯性。

4. 法律纠纷与诉讼风险：

   • 风险描述：因印章管理不善引发的法律纠纷和诉讼案件屡见不鲜。一旦公司陷入诉讼，不仅需承担诉讼费用，还可能因印章使用不当而承担不利法律后果。
   • 建议措施：加强员工法律意识培训，提高员工对印章管理重要性的认识。同时，定期对印章管理制度进行审查和更新，确保其符合法律法规和公司实际需求。

总结与建议：

将合同章、法人章、公司公章放在一起管理存在诸多风险，包括表见代理与越权使用风险、印章遗失或被盗用风险、内部管理混乱与效率低下风险以及法律纠纷与诉讼风险。为降低这些风险，公司应建立严格的印章管理制度，明确印章使用权限和审批流程，加强印章保管场所的安全措施，并利用现代信息技术手段提高印章使用的透明度和可追溯性。

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