您购买的公寓被他人注册了公司，这确实是一个需要重视的问题，您有权要求对方停止侵权行为并消除影响。 以下是具体分析和建议：

1. 核实注册信息
   首先，您需要通过工商部门（如国家企业信用信息公示系统）查询该公司的注册信息，确认注册地址是否确实为您的公寓，并记录注册时间、公司名称、法定代表人等关键信息。这一步是后续维权的基础，确保您掌握准确的侵权证据。

2. 与注册方协商
   在掌握注册信息后，您可以尝试联系公司法定代表人或实际控制人，要求其限期变更注册地址或注销公司。协商时需注意保留书面沟通记录（如邮件、短信），若对方拒绝配合，可明确告知其侵权行为及法律后果（如《公司登记管理条例》第六十四条规定的虚假登记处罚）。

3. 向工商部门投诉
   若协商无果，您可向公司注册地的市场监督管理局提交书面投诉材料，包括：

   • 产权证明（房产证、购房合同等）；
     
   • 对方公司注册信息截图；
     
   • 沟通记录（如有）；
     
   • 书面陈述（说明您未同意对方使用地址）。
     工商部门将依法调查，若认定注册地址虚假，可责令公司变更或撤销登记。

4. 提起行政诉讼（备选）
   若工商部门未及时处理或您对处理结果不满，可向法院提起行政诉讼，要求撤销公司登记。此路径需准备充分证据（如物业证明、邻居证言等辅助证明您未出租或允许使用地址），诉讼周期可能较长，但具有强制执行力。

5. 防范潜在风险
   在问题解决前，您需警惕以下风险：

   • 税务连带责任：若公司未履行纳税义务，税务机关可能将您列为关联方调查；
     
   • 债务纠纷：若公司涉及诉讼，债权人可能申请查封您的房产（需证明您无过错方可免责）；
     
   • 信用影响：长期未解决可能影响您的个人征信记录。
     建议定期查询公司经营状态，保留所有维权记录。

行动建议顺序：

1. 立即查询并固定证据 → 2. 书面要求对方整改 → 3. 向工商部门投诉 → 4. 必要时启动行政诉讼。
   

若您在操作过程中遇到具体问题（如如何撰写投诉材料、证据收集技巧等），可随时向我咨询，我会结合您的实际情况提供进一步指导。