针对您提出的问题，即公司申请了伤残鉴定但之后反而不认可的情况，受害者可以采取以下步骤来维护自己的权益：

首先，我们需要明确的是，伤残鉴定是确定工伤职工伤残等级的重要依据，它对于后续的工伤赔偿、医疗待遇等都有着至关重要的影响。如果公司申请了伤残鉴定但之后不认可，这确实会给受害者带来困扰，但受害者并非无计可施。

一、核实伤残鉴定报告的合法性和有效性

1. 检查鉴定机构资质：确保进行伤残鉴定的机构是具有合法资质的，且该机构在相关领域内具有权威性和公信力。
2. 确认鉴定程序合规：伤残鉴定应遵循严格的程序，包括鉴定申请、受理、鉴定、出具报告等环节。受害者应确认这些程序是否都得到了合规执行。
3. 审查鉴定报告内容：仔细阅读鉴定报告，确认报告中的结论是否基于充分的证据和合理的分析，以及是否明确指出了伤残等级和相应的依据。

二、与公司沟通协商

1. 表达诉求：与公司进行沟通，明确表达自己对伤残鉴定结果的认可，并要求公司按照鉴定结果给予相应的工伤赔偿和待遇。
2. 提供证据：如果公司提出异议，受害者应提供伤残鉴定报告作为证据，并解释报告中的结论和依据。
3. 寻求共识：尝试与公司达成共识，如果公司仍然不认可，可以提出重新鉴定的建议，或者寻求第三方调解机构的帮助。

三、寻求法律援助或提起诉讼

1. 咨询律师：如果与公司沟通无果，受害者可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可行的维权途径。
2. 提起劳动仲裁：根据《劳动争议调解仲裁法》，受害者可以向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求公司认可伤残鉴定结果并给予相应赔偿。
3. 提起诉讼：如果劳动仲裁结果不满意，受害者还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的权益。

四、其他注意事项

1. 保留证据：在整个过程中，受害者应保留好所有与伤残鉴定和工伤赔偿相关的证据，包括医疗记录、鉴定报告、沟通记录等。
2. 关注时效：注意劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，受害者应及时采取行动，避免错过维权时机。

综上所述，面对公司申请伤残鉴定后反而不认可的情况，受害者应核实伤残鉴定报告的合法性和有效性，与公司沟通协商，寻求法律援助或提起诉讼，并保留好相关证据和关注时效。希望这些建议能对您有所帮助。