违规确权双份土地的处理方式需根据具体情况分情况讨论，核心结论如下：

1. 若确权行为违反法定程序或实体规定
   根据《土地管理法》第十四条及《农村土地承包法》第二十二条，土地确权需遵循“依法、自愿、有偿”原则，且一户只能拥有一处宅基地（农村集体土地）。若通过伪造材料、重复申请等手段违规取得双份土地确权，行政机关有权依职权撤销错误确权决定，并收回多余土地。例如：

   • 农村宅基地确权中，若家庭已拥有一处宅基地，又通过隐瞒信息确权另一处，乡镇政府可启动撤销程序；
     
   • 承包地确权中，若同一地块被重复确权给不同主体，县级农业农村部门需通过调查核实后更正登记。

2. 若确权行为涉及利益输送或腐败
   若违规确权与公职人员滥用职权、受贿等行为相关（如《刑法》第三百八十二条贪污罪、第三百八十五条受贿罪），除行政撤销外，还可能追究刑事责任。此时：

   • 行政层面：自然资源部门需配合纪检监察机关调查，同步撤销错误确权；
     
   • 刑事层面：涉案公职人员可能面临有期徒刑、罚金等处罚，违规取得的土地使用权需依法没收。

3. 若确权行为因历史遗留问题导致
   对于因政策衔接不畅、登记系统错误等非主观故意形成的双份确权（如早期手工登记与电子系统重复录入），处理方式以“纠正错误、保障权益”为原则：

   • 行政机关需主动核查历史档案，通过公告、听证等程序确认实际权利人；
     
   • 若涉及多方利益冲突（如继承纠纷、邻里争议），可引导通过民事诉讼明确权属，再依据生效判决调整确权登记。

实务建议：

• 对权利人而言：若发现自身土地被违规确权给他人，可向县级自然资源部门申请异议登记，并提交权属证明材料；
  
• 对行政机关而言：需建立土地确权动态核查机制，定期比对宅基地、承包地登记信息，避免重复确权；
  
• 对争议双方而言：优先通过协商、调解解决，协商不成可依法提起行政复议或行政诉讼（针对确权行为）或民事诉讼（针对权属争议）。
  

如有具体案件细节（如土地类型、确权方式、争议主体等），可进一步向我说明，我将结合《民法典》物权编、《土地管理法实施条例》等法规提供针对性分析。