客车将座位调整成卧铺座违反了道路运输安全及客运经营相关法律规定，处罚时主要适用《中华人民共和国道路运输条例》及《道路旅客运输及客运站管理规定》。具体分析如下：

1. 违反的法律

   • 《中华人民共和国道路运输条例》：该条例明确规定了客运车辆应当按照核定的座位数载客，不得擅自改变车辆用途或结构。将客车座位调整成卧铺座，实际上改变了车辆原有的座位布局和用途，违反了条例中关于车辆使用和安全的规定。
   • 《道路旅客运输及客运站管理规定》：此规定进一步细化了客运车辆的管理要求，包括车辆的技术条件、安全设施等。将座位调整成卧铺座可能影响到车辆的安全性能，如紧急疏散、乘客固定等，从而违反了相关规定。

2. 处罚时适用的法规

   • 在对这种违法行为进行处罚时，主要依据的是《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定。根据条例，对于擅自改装已取得车辆营运证的车辆的，县级以上道路运输管理机构可以责令改正，并处以罚款。具体罚款数额根据违法情节的严重程度而定，一般会有一定的幅度范围。
   • 同时，如果这种改装行为导致了安全事故或存在重大安全隐患，还可能涉及到《中华人民共和国刑法》中关于危险驾驶罪或重大责任事故罪等条款的适用，但这需要具体案件具体分析。

建议：作为客运经营者或车辆所有者，应严格遵守相关法律法规，不得擅自改变车辆用途或结构。如果需要进行车辆改装或升级，应提前向相关部门申请并获得批准，确保改装后的车辆符合安全标准和法律规定。如果遇到相关法律问题，可以直接向我咨询。