结论：仅凭“征用协议最后工程完工后土地使用权归集体所有”这一条款，不能直接判定为法律意义上的“征收”，是否构成征收需结合协议整体内容、目的及实际履行情况综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、法律上“征收”的定义与核心要件

根据《中华人民共和国土地管理法》及相关法规，征收是指国家为了公共利益的需要，依法将集体所有的土地转为国有，并给予合理补偿的法律行为。其核心要件包括：

1. 主体合法性：必须由县级以上人民政府组织实施，其他主体无权征收。
2. 目的合法性：必须基于公共利益（如基础设施建设、公益事业等）。
3. 程序合法性：需履行审批、公告、听证、补偿安置等法定程序。
4. 结果合法性：土地所有权从集体转为国有，原集体失去土地所有权。

若协议中仅约定“工程完工后土地使用权归集体”，未涉及所有权转移或国家取得土地，则不符合征收的法定结果要件。

二、协议条款的性质分析

1. 若协议本质是“临时用地”或“项目合作”
   若协议目的是为某项目临时使用土地（如施工场地），工程完工后土地仍归集体所有，且未改变土地所有权性质，则属于临时用地或项目合作协议，而非征收。例如：

   • 某企业为修建厂房临时占用集体土地，约定完工后恢复原状并归还集体，此时土地所有权未变更，不构成征收。
     
   • 协议中若明确“国家不取得土地所有权”，则排除征收可能。

2. 若协议本质是“征收补偿安置协议”的变通表述
   若协议虽未直接使用“征收”一词，但实际履行了征收的全部程序（如政府主导、公共利益目的、补偿安置等），且约定“工程完工后土地使用权归集体”仅是补偿安置的一种方式（如留地安置），则可能被认定为征收的变通形式。例如：

   • 政府为修建公路征收集体土地，约定将部分土地作为集体发展用地，所有权仍归国家，但使用权归集体，此时属于征收后的补偿安置措施，仍构成征收。
     
   • 需结合协议全文及实际履行情况判断是否符合征收实质要件。

三、关键区分点：所有权是否转移

征收的核心是土地所有权从集体转为国有。若协议中：

• 明确土地所有权仍归集体（如“工程完工后土地所有权及使用权均归集体”），则不构成征收；
  
• 未明确所有权归属，但实际未履行征收程序（如无政府审批、未公告、未补偿），则可能涉嫌违法用地，而非合法征收；
  
• 约定所有权归国家，但使用权归集体（如留地安置），则属于征收后的补偿安置，仍构成征收。

四、法律建议

1. 审查协议全文：重点查看协议主体（是否为政府）、目的（是否为公共利益）、程序（是否履行法定征收程序）、补偿条款（是否合理）及所有权归属条款。
   
2. 核实政府行为：若涉及政府项目，可要求其出示征收批准文件、公告等材料，确认是否依法征收。
   
3. 咨询专业律师：若协议内容模糊或存在争议，建议携带协议文本及背景材料，由律师分析是否构成征收及合法性。

总结：仅凭“工程完工后土地使用权归集体”无法直接判定为征收，需结合协议整体内容、目的及实际履行情况综合判断。若涉及土地权益争议，建议及时咨询律师以维护合法权益。