结论：班主任公出是否应该扣班主任费，不能一概而论，需结合具体合同约定、学校规章制度以及相关法律法规来综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、合同约定角度

如果班主任与学校之间签订的劳动合同或相关协议中，明确规定了班主任在公出期间班主任费的发放标准或扣除情形，那么双方应严格按照合同约定执行。

• 若合同中有明确规定：例如，合同中可能规定班主任公出期间班主任费全额发放、部分发放或不予发放，或者规定在特定条件下（如公出天数超过一定限度）才扣除班主任费等。在这种情况下，学校应依据合同约定来处理班主任费的发放问题。
• 若合同中无明确规定：则双方应协商解决，或参考学校的相关规章制度来处理。

二、学校规章制度角度

学校作为用人单位，通常会制定一系列规章制度来规范教职工的行为和管理。这些规章制度中可能包含关于班主任公出期间班主任费发放或扣除的规定。

• 若规章制度中有明确规定：且该规定不违反法律法规的强制性规定，也不损害班主任的合法权益，那么学校可以依据规章制度来处理班主任费的发放问题。但需要注意的是，学校在制定规章制度时，应充分听取教职工的意见和建议，确保规章制度的合理性和合法性。
• 若规章制度中无明确规定：或规定不明确、存在争议，则双方应协商解决，或依据相关法律法规来处理。

三、法律法规角度

在处理班主任公出期间班主任费发放问题时，还应考虑相关法律法规的规定。

• 劳动法相关规定：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利。班主任作为劳动者，其劳动报酬（包括班主任费）应得到保障。如果学校无正当理由扣除班主任费，可能构成违法行为。
• 工资支付规定：根据《工资支付暂行规定》等相关规定，用人单位应按照劳动合同约定或国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果学校因班主任公出而扣除其班主任费，且该扣除行为不符合合同约定或国家规定，那么学校可能面临法律责任。

四、建议与措施

1. 查阅合同与规章制度：班主任应首先查阅自己与学校签订的劳动合同以及学校的相关规章制度，了解关于公出期间班主任费发放或扣除的具体规定。
2. 与学校协商：如果合同或规章制度中无明确规定，或规定存在争议，班主任应与学校进行协商，寻求合理的解决方案。
3. 寻求法律援助：如果协商无果，且班主任认为学校的扣除行为侵犯了自己的合法权益，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，通过法律途径维护自己的权益。

总结：班主任公出是否应该扣班主任费，需结合合同约定、学校规章制度以及相关法律法规来综合判断。在处理此类问题时，建议班主任先查阅相关合同和规章制度，与学校进行协商，并在必要时寻求法律援助。如果你有具体的合同条款、学校规章制度或相关情况需要咨询，可以直接向我提问，我会为你提供更详细的法律建议。